Exclusive Agency for Korea

条形 baner-03

Chynhyrchion

Llyfrgelloedd Illumina a wnaed ymlaen llaw

Mae Technoleg Dilyniannu Illumina, sy'n seiliedig ar ddilyniant gan synthesis (SBS), yn arloesi NGS a gofleidir yn fyd -eang, sy'n gyfrifol am gynhyrchu dros 90% o ddata dilyniannu'r byd. Mae egwyddor SBS yn cynnwys delweddu terfynwyr cildroadwy wedi'i labelu'n fflwroleuol wrth i bob DNTP gael ei ychwanegu, a'i glirio wedi hynny i ganiatáu ymgorffori'r sylfaen nesaf. Gyda'r pedwar DNTPs gwrthdroadwy wedi'u rhwymo gan derfynydd ym mhob cylch dilyniannu, mae cystadleuaeth naturiol yn lleihau gogwydd corffori. Mae'r dechnoleg amlbwrpas hon yn cefnogi llyfrgelloedd un-ddarllen a phâr, gan arlwyo i ystod o gymwysiadau genomig. Mae galluoedd trwybwn uchel a manwl gywirdeb dilyniant Illumina yn ei leoli fel conglfaen mewn ymchwil genomeg, gan rymuso gwyddonwyr i ddatrys cymhlethdodau genomau gyda manylion ac effeithlonrwydd heb eu cyfateb.

Mae ein Gwasanaeth Dilyniannu Llyfrgell a wnaed ymlaen llaw yn galluogi cwsmeriaid i baratoi llyfrgelloedd dilyniannu o ffynonellau amrywiol (mRNA, genom cyfan, amplicon, llyfrgelloedd 10x, ymhlith eraill). Yn dilyn hynny, gellir cludo'r llyfrgelloedd hyn i'n Canolfannau Dilyniannu ar gyfer rheoli ansawdd a dilyniannu mewn llwyfannau Illumina.


Manylion y Gwasanaeth

Canlyniad Demo

Nodweddion

Llwyfannau:Illumina Novaseq 6000 a Novaseq X Plus

Moddau dilyniannu:PE150 a PE250

Rheoli ansawdd llyfrgelloedd cyn dilyniannu

Dilyniant Data QC a Chyflenwi:Cyflwyno Adroddiad QC a Data Amrwd ar ffurf FastQ ar ôl Demultiplexing a Hidlo Q30 Reads

 

 

Manteision gwasanaeth

Amlochredd gwasanaethau dilyniannu:Gall y cwsmer ddewis ei ddilyniannu wrth lôn, cell llif, neu yn ôl faint o ddata sy'n ofynnol (dilyniant lôn rannol).

Profiad helaeth ar blatfform dilyniannu Illumina:gyda miloedd o brosiectau caeedig gyda rhywogaethau amrywiol. 

Cyflwyno Adroddiad QC Dilyniannu:gyda metrigau ansawdd, cywirdeb data a pherfformiad cyffredinol y prosiect dilyniannu.

Proses Dilyniannu Aeddfed:Gydag amser troi byr o gwmpas.

Rheoli Ansawdd Trwyadl: Rydym yn gweithredu gofynion QC llym i warantu darparu canlyniadau o ansawdd uchel yn gyson.

 

 

Llwyfannau sampl

Blatfform

Llifo cell

Modd Dilyniannu

Unedau

Allbwn Amcangyfrifedig

Novaseq x

10b (8 lôn)

PE150

Lôn sengl

Lôn rannol

375gb / lôn

25b (8 lôn)

PE150

Lôn sengl

Lôn rannol

1000 GB/Lôn

Novaseq 6000

Cell llif sp (2 lôn)

PE250

Llifo cell

Lôn sengl

Lôn rannol

325-400 m yn darllen / lôn

Cell Llif S4 (4 lôn)

PE150

Llifo cell

Lôn sengl

Lôn rannol

~ 800 GB / lôn

Gofynion Sampl

 

Swm data (x)

Crynodiad (qpcr/nm)

Nghyfrol

Dilyniant lôn rhannol

 

 

X ≤ 10 gb

≥ 1 nm

≥ 25 μl

10 GB <x ≤ 50 GB

≥ 2 nm

≥ 25 μl

50 gb <x ≤ 100 gb

≥ 3 nm

≥ 25 μl

X> 100 GB

≥ 4 nm

≥ 25 μl

Dilyniannu lôn

Y lôn

≥ 1.5 nm / pwll llyfrgell

Pwll ≥ 25 μl / llyfrgell

Yn ogystal â chrynodiad a chyfanswm, mae angen patrwm brig addas hefyd.

SYLWCH: Mae angen Phix Spike-in i ddilyniant lôn o lyfrgelloedd amrywiaeth isel er mwyn sicrhau galw sylfaen gadarn.

Rydym yn argymell cyflwyno llyfrgelloedd wedi'u gosod ymlaen llaw fel samplau. Os oes angen bmkgene arnoch i berfformio cronni llyfrgelloedd, cyfeiriwch ato

Gofynion y Llyfrgell ar gyfer Dilyniannu Lôn Rhannol.

Maint Llyfrgell (map brig)

Dylai'r prif uchafbwynt fod o fewn 300-450 bp.
Dylai fod gan lyfrgelloedd un prif gopa, dim halogiad addasydd a dim dimers primer.

Os gwelwch yn dda estyn allan atom os nad yw'ch samplau'n cwrdd â'r gofynion deunydd cychwynnol.

Llif Gwaith Gwasanaeth

Paratoi sampl

Rheoli Ansawdd Llyfrgell

Dilyniant

Dilyniant

Dadansoddiad Data

Rheoli Ansawdd Data

Sampl QC

Cyflenwi Prosiect


  • Blaenorol:
  • Nesaf:

  • Adroddiad QC Llyfrgell

    Darperir adroddiad ar ansawdd y llyfrgell cyn dilyniannu, asesu swm y llyfrgell, a darnio.

     

    Dilyniannu Adroddiad QC

     

    Tabl 1. Ystadegau ar Ddilyniant Dilyniannu.

    ID Sampl

    Bmkid

    RAW yn darllen

    Data crai (bp)

    Darlleniadau Glân (%)

    C20 (%)

    C30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6,861,036,000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    Ffigur 1. Dosbarthiad ansawdd ar hyd darlleniadau ym mhob sampl

    A9

    Ffigur 2. Dosbarthiad Cynnwys Sylfaenol

    A10

    Ffigur 3. Dosbarthiad Cynnwys Darllen mewn Data Dilyniannu

    A11

     

    Cael Dyfyniad

    Ysgrifennwch eich neges yma a'i hanfon atom

    Anfonwch eich neges atom: