●Llwyfannau:Illumina Novaseq 6000 a Novaseq X Plus
●Moddau dilyniannu:PE150 a PE250
●Rheoli ansawdd llyfrgelloedd cyn dilyniannu
●Dilyniant Data QC a Chyflenwi:Cyflwyno Adroddiad QC a Data Amrwd ar ffurf FastQ ar ôl Demultiplexing a Hidlo Q30 Reads
●Amlochredd gwasanaethau dilyniannu:Gall y cwsmer ddewis ei ddilyniannu wrth lôn, cell llif, neu yn ôl faint o ddata sy'n ofynnol (dilyniant lôn rannol).
●Profiad helaeth ar blatfform dilyniannu Illumina:gyda miloedd o brosiectau caeedig gyda rhywogaethau amrywiol.
●Cyflwyno Adroddiad QC Dilyniannu:gyda metrigau ansawdd, cywirdeb data a pherfformiad cyffredinol y prosiect dilyniannu.
●Proses Dilyniannu Aeddfed:Gydag amser troi byr o gwmpas.
●Rheoli Ansawdd Trwyadl: Rydym yn gweithredu gofynion QC llym i warantu darparu canlyniadau o ansawdd uchel yn gyson.
Blatfform | Llifo cell | Modd Dilyniannu | Unedau | Allbwn Amcangyfrifedig |
Novaseq x | 10b (8 lôn) | PE150 | Lôn sengl Lôn rannol | 375gb / lôn |
25b (8 lôn) | PE150 | Lôn sengl Lôn rannol | 1000 GB/Lôn | |
Novaseq 6000 | Cell llif sp (2 lôn) | PE250 | Llifo cell Lôn sengl Lôn rannol | 325-400 m yn darllen / lôn |
Cell Llif S4 (4 lôn) | PE150 | Llifo cell Lôn sengl Lôn rannol | ~ 800 GB / lôn |
Swm data (x) | Crynodiad (qpcr/nm) | Nghyfrol | |
Dilyniant lôn rhannol
| X ≤ 10 gb | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
50 gb <x ≤ 100 gb | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
Dilyniannu lôn | Y lôn | ≥ 1.5 nm / pwll llyfrgell | Pwll ≥ 25 μl / llyfrgell |
Yn ogystal â chrynodiad a chyfanswm, mae angen patrwm brig addas hefyd.
SYLWCH: Mae angen Phix Spike-in i ddilyniant lôn o lyfrgelloedd amrywiaeth isel er mwyn sicrhau galw sylfaen gadarn.
Rydym yn argymell cyflwyno llyfrgelloedd wedi'u gosod ymlaen llaw fel samplau. Os oes angen bmkgene arnoch i berfformio cronni llyfrgelloedd, cyfeiriwch ato
Gofynion y Llyfrgell ar gyfer Dilyniannu Lôn Rhannol.
Dylai'r prif uchafbwynt fod o fewn 300-450 bp.
Dylai fod gan lyfrgelloedd un prif gopa, dim halogiad addasydd a dim dimers primer.
Darperir adroddiad ar ansawdd y llyfrgell cyn dilyniannu, asesu swm y llyfrgell, a darnio.
Tabl 1. Ystadegau ar Ddilyniant Dilyniannu.
ID Sampl | Bmkid | RAW yn darllen | Data crai (bp) | Darlleniadau Glân (%) | C20 (%) | C30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Ffigur 1. Dosbarthiad ansawdd ar hyd darlleniadau ym mhob sampl
Ffigur 2. Dosbarthiad Cynnwys Sylfaenol
Ffigur 3. Dosbarthiad Cynnwys Darllen mewn Data Dilyniannu