Exclusive Agency for Korea

Bmkcloud mewngofnodi

Chynhyrchion

Dilyniant DNA/RNA -PACBIO Dilyniant

Dilyniant DNA/RNA -PACBIO Sequencer Delwedd dan sylw

Mae platfform dilyniannu PACBIO yn blatfform dilyniannu hir-ddarllen, a elwir hefyd yn un o dechnolegau dilyniannu trydydd cenhedlaeth (TGS). Mae'r dechnoleg graidd, amser real un-moleciwl (SMRT), yn grymuso cynhyrchu darlleniadau gyda degau o gilo-sylfaen o hyd. Ar y sylfaen o “ddilyniant-wrth-synthesis”, cyflawnir datrysiad niwcleotid sengl gan donnau tonnau modd sero (ZMW), lle mai dim ond cyfaint cyfyngedig ar y gwaelod (safle synthesis moleciwl), sy'n cael ei oleuo. Yn ogystal, mae dilyniant SMRT i raddau helaeth yn osgoi gogwydd dilyniant-benodol yn system NGS, yn yr ystyr nad oes angen y rhan fwyaf o gamau ymhelaethu PCR yn y broses adeiladu llyfrgelloedd.

Llwyfan: Dilyniant II, Revio

Cysylltwch â ni

Manylion y Gwasanaeth

Canlyniadau Demo

Nodweddion

Dau fodd dilyniannu ar ddilyniant Pacbio: darllen hir parhaus (CLR) a darllen consensws cylchol (CCS)

Modd Dilyniannu

Maint llyfrgell

Data damcaniaetholNghynnyrch

Un sylfaenNghywirdeb

Ngheisiadau

Clr

20kb, 30kb, ac ati.

80 GB i 130 GB

Tua. 85%

De novo, Galw sv, ac ati.

CCS

15-20 kb

14 i 40 Gb/cell (dilyniant II)

70 i 110 GB/Cell (Revio)

Yn dibynnu ar y samplau

Tua. 99%

De novo, Snp/indel/sv galw, iso-seq,

Cymhariaeth o berfformiad a nodweddion Revio a Sequel II

Nhelerau	System Dilyniant II	System Revio	Gynyddet
Dwysedd uwch	8 miliwn o ZMWs	25 miliwn o ZMWs	3x
Camau annibynnol	1	4	4x
Amseroedd rhedeg byrrach	30 awr	24 awr	1.25x
30x hifi genomau dynol / blwyddyn	88	1,300	15x yn gyffredinol

Manteision gwasanaeth

● Dros 8 mlynedd o brofiad ar blatfform dilyniannu Pacbio gyda miloedd o brosiectau caeedig gyda rhywogaethau amrywiol.

● Wedi'i gyfarparu'n llawn â'r llwyfannau dilyniannu PACBIO diweddaraf, Revio i warantu trwybwn dilyniant digonol.

● Amser troi cyflymach, cynnyrch data uwch a data mwy cywir.

● Cyfrannwyd mewn cannoedd o gyhoeddiadau effaith uchel sy'n seiliedig ar Pacbio.

Gofynion Sampl

Math o sampl

Swm

Crynodiad （qubit®）

Nghyfrol

Burdeb

Eraill

DNA Genomig

Dibynnu ar ofyniad data

≥50 ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.2;
OD260/230 = 1.8-2.5 ；
Copa clir ar 260 nm ，dim halogiadau

Mae angen mesur crynodiad yn ôl qubit a qubit/nanopore = 0.8-2.5

Cyfanswm yr RNA

≥1.2μg

≥120 ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.5;
OD260/230 = 0.5-2.5 ；dim halogiadau

Gwerth rin ≥7.5

5≥28S/18S≥1

Llif Gwaith Gwasanaeth

Paratoi sampl

Adeiladu Llyfrgell

Dilyniant

Dadansoddiad Data

Cyflenwi Prosiect

Blaenorol: Gwasanaeth Dilyniannu MRNA Gwneuthurwr OEM-Dilyniant Hir nad yw'n Codio-Illumina-Biomarcwr

Nesaf: Llyfrgelloedd Illumina a wnaed ymlaen llaw

Cynnyrch data 1.in-tŷ

Data a gynhyrchir o 63 o gelloedd ccs (o 26 rhywogaeth)

Data-Pacbio-CCS-15 KB	Chyfartaleddwch	Max	Mini	Ganolrif
Cynnyrch - SiubReads (GB)	421.12	544.27	221.38	426.58
Yiled - CCS (GB)	25.93	38.59	10.86	25.43
Polymeras N50	145,651	175,430	118,118	144,689
Subreads N50	17,509	23,924	12,485	17,584
CCS N50	14,490	19,034	9,876	14,747
Hyd-polymeras ar gyfartaledd	67,995	89,379	49,664	66,433
Hyd-subfreads ar gyfartaledd	15,866	21,036	11,657	16,012
Hyd cyfartalog-ccs	14,489	19,074	8,575	14,655

Data a gynhyrchir o 16 cell CLR (o 76 o rywogaethau)

Data-pacbio-clr-30kb	Chyfartaleddwch	Max	Mini	Ganolrif
Cynnyrch - SiubReads (GB)	142.20	291.40	50.55	142.49
Polymeras N50	39,456	121,191	15,389	35,231
Subreads N50	28,490	41,012	14,430	29,063
Hyd-polymeras ar gyfartaledd	22,063	48,886	8,747	21,555
Hyd-subfreads ar gyfartaledd	17,720	27,225	8,293	17,779

2.Data QC - DemoYstadegau ar Gynnyrch Data

Samplant	Mae CCS yn darllen num	Cyfanswm y seiliau CCS (BP)	Mae CCS yn darllen N50 (BP)	hyd cymedrig ccs (bp)	CCS Darllen Hiraf (BP)	SiBreads Canolfannau (BP)	Cyfradd CCS (%)
Pb_bmkxxx	3,444,159	54,164,122,586	15,728	15,726	36,110	863,326,330,465	6.27