Dilyniant Circrna-Illumina
Nodweddion
● Disbyddu rRNA wedi'i ddilyn gan baratoi llyfrgell cyfeiriadol, gan alluogi data dilyniannu llinyn-benodol.
● Mae llif gwaith biowybodegol yn galluogi rhagfynegiad circRNA a meintioli mynegiant
Manteision gwasanaeth
●Llyfrgelloedd RNA mwy cynhwysfawr:Rydym yn defnyddio disbyddu rRNA yn lle disbyddu RNA llinol yn ein paratoad cyn-lyfrgell, gan sicrhau bod y data dilyniannu yn cynnwys nid yn unig circRNA ond hefyd mRNA a lncRNA, gan alluogi dadansoddiad ar y cyd o'r setiau data hyn ar y cyd o'r setiau data hyn
●Dadansoddiad dewisol o rwydweithiau RNA mewndarddol cystadleuol (CERNA): Yn darparu mewnwelediadau dyfnach i fecanweithiau rheoleiddio cellog
●Arbenigedd helaeth: Gyda hanes o brosesu dros 20,000 o samplau yn BMKGENE, yn rhychwantu mathau o samplau amrywiol a phrosiectau lncRNA, mae ein tîm yn dod â chyfoeth o brofiad i bob prosiect.
●Rheoli Ansawdd Trwyadl: Rydym yn gweithredu pwyntiau rheoli craidd ar draws pob cam, o baratoi sampl a llyfrgell i ddilyniannu a biowybodeg. Mae'r monitro manwl hwn yn sicrhau bod canlyniadau o ansawdd uchel yn gyson.
● Cefnogaeth ôl-werthu: Mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau'r prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu 3 mis. Yn ystod yr amser hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n gysylltiedig â'r canlyniadau.
Gofynion sampl a danfon
| Lyfrgell | Blatfform | Data a argymhellir | Data QC |
| llyfrgell gyfeiriadol disbyddodd rRNA | Illumina PE150 | 16-20 GB | C30≥85% |
Gofynion Sampl:
Niwcleotidau:
| Conc. (Ng/μl) | Swm (μg) | Burdeb | Uniondebau |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Dangosir halogiad cyfyngedig neu ddim protein neu DNA ar gel. | Rin≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; Drychiad cyfyngedig neu ddim llinell sylfaen |
● Planhigion:
Gwraidd, coesyn neu betal: 450 mg
Deilen neu had: 300 mg
Ffrwythau: 1.2 g
● Anifeiliaid:
Calon neu goluddyn: 450 mg
Viscera neu ymennydd: 240 mg
Cyhyr: 600 mg
Esgyrn, gwallt neu groen: 1.5g
● Arthropodau:
Pryfed: 9g
Crustacea: 450 mg
● Gwaed cyfan:2 diwb
● Celloedd: 106 gelloedd
● serwm a phlasma: 6 ml
Danfon sampl a argymhellir
Cynhwysydd: tiwb centrifuge 2 ml (ni argymhellir ffoil tun)
Labelu sampl: grŵp+dyblygu ee a1, a2, a3; B1, B2, B3.
Cludo:
1. Iâ sych: Mae angen pacio samplau mewn bagiau a'u claddu mewn rhew sych.
2. Tiwbiau RNASTABLE: Gellir sychu samplau RNA mewn tiwb sefydlogi RNA (ee, RNASTABLE®) a'u cludo ar dymheredd yr ystafell.
Llif Gwaith Gwasanaeth
Dylunio Arbrofi
Dosbarthu Sampl
Echdynnu RNA
Adeiladu Llyfrgell
Dilyniant
Dadansoddiad Data
Gwasanaethau ar ôl gwerthu
Biowybodeg
Rhagfynegiad CircRNA: Dosbarthiad Cromosomaidd
CircRNAs a fynegwyd yn wahanol - plot llosgfynydd
CircRNAs a fynegir yn wahanol - Clystyru hierarchaidd
Cyfoethogi swyddogaethol genynnau gwesteiwr circrna
Archwiliwch y datblygiadau ymchwil a hwylusir gan wasanaethau dilyniannu BMKGENE 'CircRNA trwy gasgliad wedi'i guradu o gyhoeddiadau.
Wang, X. et al. (2021) 'Mae CPSF4 yn rheoleiddio ffurfiad circRNA a distewi genynnau cyfryngol microRNA mewn carcinoma hepatocellular', oncogene 2021 40:25, 40 (25), tt. 4338–4351. doi: 10.1038/a41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'Mae trawsgrifiadome x oo-ymatebol yn datgelu rôl yr RNA133 cylchol mewn ymwrthedd i glefydau trwy reoleiddio mynegiant Osarab mewn reis', ymchwil ffytopatholeg, 5 (1), tt. 1–14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/ffigurau/6.
Y, H. et al. (2023) 'Mae CPSF3 yn modiwleiddio cydbwysedd trawsgrifiadau cylchol a llinol mewn carcinoma hepatocellular'. doi: 10.21203/rs.3.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'Gwerthusiad cynhwysfawr o circRNAs mewn cardiomyopathi cirrhotic cyn ac ar ôl trawsblannu afu', imiwnopharmacoleg ryngwladol, 114, t. 109495. DOI: 10.1016/j.intimp.2022.109495.
