Dilyniannu Amplicon(16S/18S/ITS)

Mae dilyniannu Amplicon (16S/18S/ITS) ag Illumina yn ddull o ddadansoddi amrywiaeth microbaidd trwy nodi proffiliau microbaidd yn ôl eu dilyniannau ac yna ceisio dehongli cyfoeth ac amrywiaeth cymunedol o fewn pob sampl a rhwng samplau. Mae piblinell BMKCloud Amplicon (NGS) yn caniatáu dadansoddi genynnau swyddogaethol 16S, 18S, ITS a lluosog. Mae'n dechrau gyda thocio darllen, cydosod darllen pen pâr ac asesu ansawdd, ac yna clystyru darlleniadau tebyg i gynhyrchu Unedau Tacsonomig Gweithredol (OTUs) a ddefnyddir mewn chwe adran ddadansoddi wahanol. Mae anodi tacsonomig yn rhoi gwybodaeth am helaethrwydd a chyfansoddiad cymharol pob sampl, tra bod dadansoddiadau amrywiaeth alffa a beta yn canolbwyntio ar amrywiaeth microbaidd o fewn samplau a rhyngddynt, yn y drefn honno. Mae dadansoddiad gwahaniaethol rhwng grwpiau yn canfod OTUs sy'n gwahaniaethu gan ddefnyddio profion parametrig ac nad ydynt yn barametrig, tra bod dadansoddiad cydberthynas yn cysylltu'r gwahaniaethau hyn â ffactorau amgylcheddol. Yn olaf, rhagfynegir helaethrwydd genynnau swyddogaethol yn seiliedig ar helaethrwydd genynnau marciwr, gan ddarparu mewnwelediad i swyddogaeth ac ecoleg ym mhob sampl.