Malé RNA jsou typ krátké nekódující RNA s průměrnou délkou 18-30 nt, včetně miRNA, siRNA a piRNA. Bylo hlášeno, že tyto malé RNA byly masivně zapojeny do různých biologických procesů, jako je degradace mRNA, inhibice translace, tvorba heterochromatinu atd. Analýza sekvenování smallRNA byla široce aplikována ve studiích o vývoji zvířat/rostlin, onemocnění, viru atd. Malá RNA byla široce aplikována Platforma sekvenční analýzy sestává ze standardní analýzy a pokročilé těžby dat. Na základě dat RNA-Seq může standardní analýza dosáhnout identifikace a predikce miRNA, predikce cílového genu miRNA, anotaci a analýzu exprese. Pokročilá analýza umožňuje přizpůsobené vyhledávání a extrakci miRNA, generování Venn Diagram, miRNA a cílovou genovou síť.
