Malá RNA

Malé RNA jsou krátké nekódující RNA s průměrnou délkou 18-30 nt, včetně miRNA, siRNA a piRNA, které hrají důležitou roli v regulačních procesech. SRNA pipeline BMKCloud poskytuje standardní i vlastní analýzu pro identifikaci miRNA. Po oříznutí čtení a kontrole kvality jsou čtení porovnána s více databázemi, aby se klasifikovaly sRNA a vybraly miRNA a mapovaly se do referenčního genomu. miRNA jsou identifikovány na základě známých miRNA databází, které poskytují informace o sekundární struktuře, rodině miRNA a cílových genech. Analýza diferenciální exprese identifikuje odlišně exprimované miRNA a odpovídající cílové geny jsou funkčně anotovány, aby se našly obohacené kategorie.