-
BMKMANU S3000_Prostorový přepis
Prostorová transkriptomika stojí v popředí vědeckých inovací a umožňuje výzkumníkům ponořit se do složitých vzorců genové exprese v tkáních při zachování jejich prostorového kontextu. Mezi různými platformami vyvinul BMKGene prostorový transkriptomový čip BMKManu S3000, který se může pochlubit zvýšeným rozlišením 3,5 µm, dosahujícím subcelulárního rozsahu a umožňujícím víceúrovňové nastavení rozlišení. Čip S3000 s přibližně 4 miliony bodů využívá mikrojamky povrstvené kuličkami naplněnými prostorově čárovými snímacími sondami. Z čipu S3000 je připravena cDNA knihovna obohacená o prostorové čárové kódy a následně sekvenována na platformě Illumina NovaSeq. Kombinace prostorově kódovaných vzorků a UMI zajišťuje přesnost a specifičnost generovaných dat. Čip BMKManu S3000 je extrémně všestranný a nabízí víceúrovňové nastavení rozlišení, které lze jemně vyladit pro různé tkáně a požadované úrovně detailů. Tato přizpůsobivost řadí čip jako vynikající volbu pro různé studie prostorové transkriptomiky, což zajišťuje přesné prostorové shlukování s minimálním šumem. Použití technologie buněčné segmentace s BMKManu S3000 umožňuje vymezení transkripčních dat k hranicím buněk, což vede k analýze, která má přímý biologický význam. Kromě toho vylepšené rozlišení S3000 vede k vyššímu počtu genů a UMI detekovaných na buňku, což umožňuje mnohem přesnější analýzu prostorových transkripčních vzorů a shlukování buněk.
-
Předem připravené knihovny DNBSEQ
DNBSEQ, vyvinutý společností MGI, je inovativní NGS technologie, které se podařilo dále snížit náklady na sekvenování a zvýšit propustnost. Příprava knihoven DNBSEQ zahrnuje fragmentaci DNA, přípravu ssDNA a amplifikaci rotujícího kruhu za účelem získání nanokuliček DNA (DNB). Ty jsou poté naneseny na pevný povrch a následně sekvenovány kombinatorickou syntézou sondy a kotvy (cPAS). Technologie DNBSEQ kombinuje výhody nízké míry chyb zesílení s použitím vzorů chyb s vysokou hustotou u nanokuliček, což vede k sekvenování s vyšší propustností a přesností.
Naše předem připravená služba sekvenování knihoven umožňuje zákazníkům připravit sekvenační knihovny Illumina z různých zdrojů (mj. mRNA, celý genom, amplikon, 10x knihovny), které jsou převedeny na knihovny MGI v našich laboratořích, aby byly sekvenovány v DNBSEQ-T7, což umožňuje vysoké objemy dat při nižších nákladech.
-
Hi-C založená chromatinová interakce
Hi-C je metoda navržená pro zachycení genomové konfigurace kombinací sondování interakcí na základě blízkosti a vysoce výkonného sekvenování. Metoda je založena na zesíťování chromatinu s formaldehydem, následovaném štěpením a opětovnou ligací tak, že pouze fragmenty, které jsou kovalentně spojeny, vytvoří ligační produkty. Sekvenováním těchto ligačních produktů je možné studovat 3D organizaci genomu. Hi-C umožňuje studovat distribuci částí genomu, které jsou lehce sbalené (kompartmenty A, euchromatin) a pravděpodobněji jsou transkripčně aktivní, a oblastí, které jsou těsněji zabaleny (kompartmenty B, heterochromatin). Hi-C lze také použít k určení topologicky asociovaných domén (TAD), oblastí genomu, které mají složené struktury a pravděpodobně mají podobné vzorce exprese, a k identifikaci chromatinových smyček, oblastí DNA, které jsou ukotveny dohromady proteiny a které jsou často obohacené o regulační prvky. Služba sekvenování Hi-C společnosti BMKGene umožňuje výzkumníkům prozkoumat prostorové dimenze genomiky, což otevírá nové cesty pro pochopení regulace genomu a jejích důsledků pro zdraví a nemoci.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
Vyčistěte vysoce kvalitní celkovou RNA z rostlinných tkání
-
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA Kit
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA Kit
Předplněná kazeta / reagenční sada pro čištění vysoce výtěžné, vysoce čisté, vysoce kvalitní celkové RNA bez inhibitorů ze zvířecí tkáně/buňky/čerstvé plné krve
-
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
Vyčistěte vysoce kvalitní genomovou DNA z různých rostlinných tkání
-
TGuide Smart Soil/Stool DNA Kit
TGuide Smart Soil/Stool DNA Kit
Čistí DNA bez inhibitorů vysoké čistoty a kvality ze vzorků půdy a stolice
-
TGuide Smart DNA Purification Kit
Obnovuje vysoce kvalitní DNA z produktu PCR nebo agarózových gelů.
-
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
Předem naplněná kazeta / destička reagenční sada pro purifikaci genomové DNA z krve a buffy coat
-
TGuide Smart Magnetic Tissue DNA Kit
Předplněná kazeta / reagenční sada pro extrakci genomové DNA ze zvířecích tkání
-
TGuide Smart Universal DNA Kit
Předem naplněná kazeta / destička s reagenciemi pro čištění genomové DNA z krve, vysušené krevní skvrny, bakterií, buněk, slin, ústních výtěrů, zvířecích tkání atd.
-
Extraktor nukleových kyselin TGuide S16
Extraktor nukleových kyselin TGuide S16
Snadno použitelný stolní nástroj, 1-8 nebo 16 vzorků současně
Katalogové číslo / balení
Kočka. žádný
ID
Počet příprav
OSE-S16-AM
1 sada
-
PacBio 2+3 Full-Length mRNA Solution
Zatímco sekvenování mRNA na bázi NGS je všestranným nástrojem pro kvantifikaci genové exprese, jeho spoléhání se na krátké čtení omezuje jeho účinnost v komplexních transkriptomických analýzách. Na druhou stranu sekvenování PacBio (Iso-Seq) využívá technologii dlouhého čtení, která umožňuje sekvenování transkriptů mRNA plné délky. Tento přístup usnadňuje komplexní průzkum alternativního sestřihu, genových fúzí a polyadenylaci, i když to není primární volba pro kvantifikaci genové exprese. Kombinace 2+3 překlenuje propast mezi Illumina a PacBio spoléháním na čtení PacBio HiFi pro identifikaci kompletní sady transkriptových izoforem a sekvenování NGS pro kvantifikaci identických izoforem.
Platformy: PacBio Sequel II/ PacBio Revio a Illumina NovaSeq;
