Genom

Shromáždění chromozomů a analýza genomu plodiny biomasy
Sekvenování nanopore | Illumina | Hi-C | RNA-sekvence | Fylogeneze
V této studii poskytovaly technologie Biomarker Technologies technickou podporu pro sekvenování nanopore, sestavení de novo genomu, sestavení asistované HI-C atd.
Abstraktní
Miscanthus, rhizomatózní trvalá rostlina, má velký potenciál pro produkci bioenergie pro svou vysokou biomasu a toleranci stresu. Hlásíme sestavu chromozomůMiscanthus lutarioripariusGenom kombinováním sekvenování Oxford Nanopore a HI-C Technologies. Sestava 2,07-GB pokrývá 96,64% genomu, s kontig N50 1,71 MB. Sekvence centromery a telomer jsou sestaveny pro všech 19 chromozomů a chromozomu 10. Allotetraploidní původ M. lutarioriparius je konfirtimován pomocí centromerických satelitních opakování. Jasně prokázána tetraploidní genomová struktura a několik chromozomálních přeskupení vzhledem k čiroku. Tandemové duplicitní genyM. Lutarioripariusjsou funkční obohaceny nejen z hlediska souvisejících s reakcí na stresování, ale také biosyntézu buněčné stěny. Rodiny genu související s odolností proti onemocnění, biosyntézou buněčné stěny a transportem kovových iontů jsou výrazně rozšířeny a vyvíjeny. Rozšíření těchto rodin může být důležitým genomickým základem pro posílení pozoruhodných vlastnostíM. Lutarioriparius.
Klíčové statistiky sestavy genomu


Postava. Přehled sestavy genomu M. Lutarioriparius
Novinky a hlavní body Cílem je sdílet nejnovější úspěšné případy s technologiemi Biomarker, zachytit nové vědecké úspěchy a také prominentní techniky aplikované během studie.
Čas příspěvku: leden-05-2022