Evoluční genetika

Cílem evolučních genetických studií je pochopit evoluční trajektorii populací pomocí informací o polymorfismu v genomických sekvencích. Evoluční genetický potrubí BMKCloud je navržen tak, aby analyzoval data WGS nebo specifickým amplifikovaným fragmentem (SLAF) z velkých populací. Po kontrole kvality surových dat jsou čtení zarovnána s referenčním genomem a jsou volány varianty. Potrubí zahrnuje fylogenetickou konstrukci stromů, analýzu hlavních složek (PCA), analýzu struktury populace, vazebnou nerovnováhu (LD), analýzu selektivního rozmítání a analýzu kandidátů.