DNBSEQ předem vyrobené knihovny
Funkce
●Platforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Režimy sekvenování:PE150
●Převod knihoven Illumina naMGI:Povolení sekvenování vysokých objemu dat za nízké náklady.
●Kontrola kvality knihoven před sekvenováním.
●Sekvenování dat QC a doručení:Poskytování zprávy QC a nezpracovaných dat ve formátu FastQ po demultiplexování a filtrování Q30 čte.
Výhody
●Všestrannost sekvenčních služeb:Zákazník se může rozhodnout pro sekvenci jízdním pruhem nebo množstvím dat.
●Vysoký výstup dat:1500 GB/pruh
●Dodávka sekvenování zprávy QC:S metrikami kvality, přesností dat a celkovým výkonem sekvenčního projektu.
●Zralý proces sekvenování:s krátkým časem obrat.
●Přísná kontrola kvality: Implementujeme přísné požadavky QC, abychom zaručili poskytování trvale vysoce kvalitních výsledků.
Vzorkové požadavky
| Částka dat (x) | Koncentrace (qpcr/nm) | Objem | |
| Částečný pruh
| X ≤ 10 GB | ≥ 1nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ||
| Jediný pruh | Na pruh | ≥ 1,5 nm / fond knihovny | ≥ 25 μl / knihovna |
Kromě koncentrace a celkové množství je také vyžadován vhodný vzorec píku.
POZNÁMKA: Sekvenování knihoven nízké rozmanitosti v Lane vyžaduje, aby Phix Spike-in zajistil robustní volání základny.
Doporučujeme odeslat předběžné knihovny jako vzorky. Pokud požadujete, aby BMKGENE provedl sdružování knihovny, přečtěte si prosím
Požadavky na knihovnu pro sekvenování částečného pruhu.
Velikost knihovny (mapa vrcholu)
Hlavní vrchol by měl být do 300-450 bp.
Knihovny by měly mít jediný hlavní vrchol, žádnou kontaminaci adaptéru a žádné dimery primeru.
Pracovní postup služeb
Zpráva QC knihovny
Zpráva o kvalitě knihovny je poskytnuta před sekvenováním, hodnocením částky knihovny a fragmentaci.
Sekvenování zprávy QC
Tabulka 1. Statistiky o sekvenčních datech.
| Ukázkový ID | BMKID | RAW čte | Nezpracovaná data (BP) | Čisté čtení (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360,100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Obrázek 1.. Distribuce kvality podél čtení v každém vzorku
Obrázek 2. distribuce základního obsahu
Obrázek 3. distribuce obsahu čtení v sekvenčních datech
