A sequenza di genoma di pianta / animale
Cappè serviziu di serviziu
● A preparazione di a biblioteca pò esse standard o pcr-free
● Disponibile in 4 Platforme di Sequencature: Illumina Novaseq, MGI T7, MGI T7, MVI T7, MVI T7, MVI T7, MVI T7, MVI T7, MVI T7, MVI T7, NANOPORE PIMONTI P48, O PACBIO REIO.
● L'analisi bioinformatica in a rilevazione di i varianti: snp, indel, SV è CNV
Vantaghji di serviziu
●I registri di sapè è publicazioni di publicazione: Esperienza accumulata in u genoma sequenza per più di 1000 spezie hè di più di 1000 casi publicati cù un fattore impattu cumulativu di più di 5000.
●Analisi BIOINFORMATIVA: Includendu a Variazione chjamata è l'annotazione di a funzione.
● Supportu di vendita post-vendite:U nostru impegnu si estende al di là di u cumpletu di u prugettu cù un periodu di serviziu dopu à 3 mesi. Durante questu tempu, offremu u seguitu di u prugettu, a risoluzione di prublemi di prublemi, è Q & A sessioni per indirizzà qualsiasi dumande ligate à i risultati.
●Ancutazione cumpleta: Utilizemu basa di dati in modu food à annunzià i geni cù variazioni identificati è l'analisi di arrogazione currenza, furnisce insignamenti prughjetti di ricerca.
Specificazioni di serviziu
| Varianti per esse identificati | Strategia Sequencing | Prufundità cunsigliata |
| Snp è indele | Illumina Novasee PEZ50 o mgi t7 | 10x |
| SV è CNV (menu precise) | 30x | |
| SV è CNV (più precisa) | Nanopore prom P48 | 20x |
| SNPS, indelli, SV è CNV | Pacbio Reio | 10x |
Esigenze di mostra
| Tessulu o acidi nucleichi estratti | Illumina / MGI | NANOPORE | Pacco
| ||
| Viscera d'animali | 0,5-1 g | ≥ 3,5 g
| ≥ 3,5 g
| ||
| Musculu animale | ≥ 5 g
| ≥ 5 g
| |||
| Sangue Mammalianu | 1,5 ml | ≥ 0,5 ml
| ≥ 5 ml
| ||
| Putile / sangue di pesci | ≥ 0,1 ml
| ≥ 0,5 ml
| |||
| Pianta- foglia fresca | 1-2 g | ≥ 2 g
| ≥ 5 g
| ||
| Cellula cultura |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
| Inscect tessuto moltu / individuale | 0,5-1 g | ≥ 1 g
| ≥ 3 g
| ||
| DNA estratto
| Cuncentrazione: ≥ 1 ng / μl Quantità: ≥ 30 ng Limitata o micca degradazione o contaminazione
| Cuncentrazione Quantità
Od260 / 280
Od260 / 230
Limitata o micca degradazione o contaminazione
| ≥ 40 ng / μl 4 μg / flussu di u flussu / mostra
1,7-2.2
≥1,5 | Cuncentrazione Quantità
Od260 / 280
Od260 / 230
Limitata o micca degradazione o contaminazione | ≥ 50 ng / μl 10 μg / flussu di u flussu
1,7-2.2
1,8-2,5 |
| Preparazione di Biblioteca Pcr-Free: Cuncentrazione 40 ng / μl AMOUNT TO 500 NG | |||||
U flussu di travagliu di serviziu
Spedizione di mostra
Estrazione di l'DNA
Custruzione di Biblioteca
SEQUENZZA
Analisi di dati
Spedizione di dati
Include l'analisi di seguente:
- Verificà di qualità di Dati Rw
- Statistiche di l'allinjamentu à u genoma di riferimentu
- Identificazione variante: snp, indel, SV è CNV
- Annotazione funzionale di varianti
Statistiche di l'allinjamentu à u genoma di riferimentu - a distribuzione di a prufundità di sequenza
SNP chjamendu à parechje campioni
Identificazione di l'indel - statistiche di a lunghezza indele in a regione CD è a regione di u genoma
Distribuzione variant attraversu i Genome - Circos Plot
Annotazione funzionale di geni cù varianti identificati - gene ontologia
Chai, Q. et al. (2023) 'Un Gluthumione S-Trasferità Ghtt14 Definiinti di fiori di fiori via regulante accumulazione di ancucina, u ghjurnale di a patina di u cotone, 4 (2), p. 433. Doi: 10.1111 / PBI.13965.
Cheng, H. et al. (2023) "livellu di livellu di selvosu è razza nova per respirazione oghjazione genomica è ghjurnale preziosu per elevuta u ghjurnale DOI: 10.1111 / PBI.14018.
Li, A. et al. (2021) 'genome di l'eru Sictu cantazioni in impattu clima è di a fermazione di u clima ", comunicazioni Biologi u 2021 4: 1, 4 (1), PP. 1-12. DOI: 10.1038 / S42003-021-02823-6.
Zeng, T. et al. (Analisi di u genuma di u 2022 è metelazione in u piridente in Indigene in u tempu di a spezia ", comunicazioni Biologia, 5 (1), Pp. 1-12. DOI: 10.1038 / S42003-022-03907-7.
