Pacbio Transcriptome full-length

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing, Isoseq, permette l'identificazione precisa di l'isoforme di trascrizione, mette in luce a poliadenilazione alternativa è splicing, è porta à una analisi di espressione genica più precisa. U pipeline di BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome hè pensatu per analizà e biblioteche di cDNA sequenziate in modalità Circular Consensus Sequencing (CCS) è identifica e sequenze Full-Length Non-Chimeric (FLNC), chì sò poi raggruppati in trascrizioni non ridondanti. Una analisi BUSCO successiva valuta a cumpleta di l'assemblea di transcriptome. Da u transcriptome assemblatu, analisi multiple sò realizate: splicing alternativu, ripetizione di sequenza simplice (SSR), predizione di lncRNA è geni di destinazione currispondenti, predizione di geni novi, analisi di famiglia di geni, analisi di fattore di trascrizione, è annotazione funzionale di trascrizioni.