Sequenza di transcriptome full-length basatu in nanopori
Nanopore sequencing si distingue da altre piattaforme di sequencing, in chì i nucleotidi sò letti direttamente senza sintesi di DNA è genera letture longu à decine di kilobases. Questu permette a lettura diretta di trascrizioni integrali è affruntà e sfide in studii transcriptomici.
√ Bassa preghjudiziu specificu di sequenza
√ Lettura integrale di cDNA per studii di struttura di geni
√ Meno dati necessarii per copre u listessu numeru di trascrizioni
√ Identificazione di parechje isoforme per genu
√ Quantificazione di l'espressione à u livellu di l'isoforma
Pipeline di Bioinformatica tipica
Ultimi Casi di Successu cù Biomarker Technologies
1. L'analisi comparative di transcriptomi full-length revelanu a dinamica di sviluppu di u troncu di Gnetum luofuense
Journal: Frontières in Genetica
Publicatu: marzu 2021
Parole chjave: MinION | Splicing alternativu | APA | lncRNA | Trascrizioni spressi di manera differenziale
Leghjite u testu cumpletu
2. Movimentu unidirezionale di picculi RNA da i rimjiet à e radiche in heterografts interspecific
Journal: Nature Plants
Publicatu: ghjennaghju 2021
Parole chjave: Nanopore | Illumina | rilevazione di mRNA mobile à longu andà
3. L'analisi di transcriptome à longu andà di e radiche d'asparagus revela u mecanismu moleculare di a tolleranza di u sali indutta da fungi mycorhizal arbuscular.
Journal: Botanica Ambientale è Sperimentale
Publicatu: ghjennaghju 2021
Parole chjave: MinION | Trascrizioni sfarente spressione | Fattori di trascrizzione | Splicing alternativu
4. Cambiamenti caratteristiche fisiulogichi è Transcriptome Full-Length di Rose (Rosa chinensis) Roots è Foglie in Risposta à u Stress di Seca
Journal: Physiology Plant and Cell
Publicatu: Ottobre 2020
Keywords: PromethION | Trascrizioni spressi diffarentimenti | Predizzione funziunale | Isoforme spliced | TF è lncRNA
5. Analisi è paragone cumpletu di PacBio è sequencing RNA basatu in nanopori di u transcriptome Arabidopsis
Journal: Metudu di a pianta
Publicatu: Apr. 2020
Parole chjave: GridION | PromethION | PacBio Sequel | Illumina NovaSeq | Allineamentu di u genoma | Identificazione di trascrizione | Splicing alternativu | SSR | LncRNA | Quantificazione isoforme
Notizie è Highlights hà u scopu di sparta l'ultimi casi di successu cù Biomarker Technologies, catturà novi successi scientifichi è tecniche prominenti applicate durante u studiu.
Tempu di Postu: 08-Jan-2022