T2T Octembly Occetamente, Genoma Gratuitu
1stDui genomi di risu1
Titulu: Assemble è a validazione di i dui genomi di riferimentu gratuiti per a risu XIn / Indica revela cunnosce in a pianta Architettura Centromere
Doi:https://Doi.org/10.1101/2020.12.24,444073
U tempu affissatu: 01 di ghjennaghju, 2021.
Istitutu: Università Agricola Huzhong, Cina
MATERIALI
O. Sativa Xian / IndicaVarietà di u risu di u risu 97 (ZS97) 'è' Minghui 63 (MH63)
Strategia Sequencing
Ngs leghje + hifi leghje + clr leghje + Biionano + Hi-C
Dati:
ZS97: 8,34 GB (~ 23x) Hifi rende + 48.39 GB (~ 131x) ClR Reads + 25 GB (~ 69x) NGS
MH63: 37.88 GB (~ 103X) Hifi rende + 48,97 GB (~ 132x) Clr Reads + 28 GB (~ 76x) NGS
Figura 1 dui genomi di u risu di gap (MH63 è ZS97)
2ndGenome di banana2
Titulu: Cromosomi TELLLERE-à-TELLLEE-à-TELLLELE
Doi:https://Doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
Tempu affissatu: 17 d'aprile 2021.
Istituto: Université Parigi-Saclay, Francia
MATERIALI
Double HaploidMusa acminatasppDICACENSIS(Dh-pahang)
Strategia è dati di sequenza:
HISEQ2500 PE250 MODE + Minion / promethione (93GB, ~ 200X) + mappa ottica (dle-1 + BSPQ1)
Tabella 1 Paragone di Musa acinminata (DH-Pahang) Enimemburciari Genami
Figura 2 Musa Goldomes Comparison
3rdPhaeodactilum Tricomeut Tricomepum3
Titulu: U genimentu di u genoma di telomeere daP
Haeodactylum Tricornutum
Doi:https://Doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
Tempu postatu: 19 di Maghju, 2021
Istitutu: Università Western, Canada
MATERIALI
PHEADODACTHOLUM TRICORTUM(Collection Cultura di Algae And Protozo CCAP 1055/1)
Strategia è dati di sequenza:
1 Oxford Nanopore Minion Flow Cell + A 2 × 75 Paired-End Mid-Out Mid-Output Nextseq 550 Run
Figura 3 Iflow di travagliu per l'Assemblea di Genom Telomere-à-Telomere
4thGenomea chm13 um marsa4
Titulu: A sequenza completa di un genoma umanu
Doi:https://Doi.org/10.1101/2021.05.26,445798
Tempu postatu: 27 di Maghju, 2021
Istitutu: Istituti Nazionali di Salute (Nih), Stati Uniti
MATERIALI: LINE CELLS CHM1E
Strategia è dati di sequenza:
30 × pacbiu circulare Consensore Sequenzione di Sequenczione, 120 ossofore Nanfore Land Riscal, 100 ××) sequenzione di lettura ,tmn), 70 × Genomino HI-C (HI-C), BIONANO Map, BIONANTO è Strand-Seq
Tabella 2 Paragone di Grch38 è T2T-NM13 Putesome Genome
Riferimentu
1.Sergey nurk et al. A sequenza completa di un genoma umanu. biorxiv 2021.05.26.445798; doi:https://Doi.org/10.1101/2021.05.26,445798
2.Caroline Belser et al. CraMosomi TELLLERE-à-telome gapless di banana cù sequenza nanopore. Biorxiv 2021.04.16.440017; doi:https://Doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.Daniel J. Gigue et al. Assemblea Telomere-à-Tel telorere di Pieodactilum Tricornutum. biurxiv 2021.05,4442596; doi:https://Doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.Jia-ming song et al. Assemblea è a validazione di i dui genomi di riferimentu gratuiti per una riso di risu XIIN / Indica revela cunnosce in a pianta Architettura di u Centro. biorxiv 2020.12.24.424073; doi:https://Doi.org/10.1101/2020.12.24,444073
Tempu post: Jan-06-2022