GENOME
Assemblage à l'échelle chromosomique et analyse du génome de la culture de biomasse Miscanthus lutarioriparius
Nanopore sequencing | Illumina | Salute-C | RNA-sequencing | Filogenia
In questu studiu, Biomarker Technologies hà furnitu supportu tecnicu nantu à a sequenza di Nanopore, l'assemblea di genoma de novo, l'assemblea assistita Hi-C, etc.
Astrattu
Miscanthus, una pianta perenne rizomatosa, hà un grande potenziale per a produzzione di bioenergia per a so alta biomassa è a tolleranza di stress. Riportemu una assemblea à scala cromusomica diMiscanthus lutarioripariusgenoma cumminendu a sequenza di Oxford Nanopore è e tecnulugia Hi-C. L'assemblea 2.07-Gb copre 96.64% di u genoma, cù contig N50 di 1.71 Mb. A sequenza di centromeri è telomeri sò assemblati per tutti i 19 cromusomi è u cromusomu 10, rispettivamente. L'origine allotetraploide di u M. lutarioriparius hè cunfirmata cù ripetizioni di satelliti centromerichi. A struttura di u genoma tetraploide è parechji riarrangiamenti cromosomiali relative à u sorgo sò chjaramente dimustrati. Tandem geni duplicati diM. lutarioripariussò arricchiti funziunali micca solu in termini ligati à a risposta di stress, ma a biosintesi di a parete cellulare. E famiglie di geni ligati à a resistenza à e malatie, a biosintesi di a parete cellulare è u trasportu di ioni metallichi sò assai sviluppati è evoluti. L'espansione di queste famiglie pò esse una basa genomica impurtante per u rinfurzà di e caratteristiche notevuli diM. lutarioriparius.
Statistiche chjave di l'assemblea di u genoma
Figura. Panoramica di u M. lutarioriparius genome assembly
Notizie è Highlights hà u scopu di sparta l'ultimi casi di successu cù Biomarker Technologies, catturà novi successi scientifichi è tecniche prominenti applicate durante u studiu.
Tempu di Postu: 05-Jan-2022