Assemblea di Genome Hi-c
Hi-C hè un metudu cuncipitu per catturà a cunfigurazione cromosome combinendu i proximità proximità è a sequenza di alta strada. L'intensità di queste interazzioni sò credi à esse correlati negativamente cù a distanza fisica nantu à i cromosomi. Dunque, dati Hi-C hè adupratu per guidà u triluto, ordine, è orientendu di sequenze in un gentoma di prugettu è anchendu quelli à un certu numaru di cromosomi. Sta tecnulugia l'assemblea di u genimu di u livellu di cromosoma in l'absenza di una mappa genetica basata in pupulazione. Ogni genere unica hà bisognu di un hi-c.
Cappè serviziu di serviziu
● Sequencing on Illumina Novaseq cù PE150.
● Serviziu esige mostre di tessuti, invece di acidi nucleichi nucleichi, à un ligame incruciatu cù formaldeiede è cunservate e interazione di a Dna-proteine.
● L'esperimentu Hi-C imblessi restituzione è a fine riparazione di u bicicletta finali cù u biotine, seguitatu da circularizazione di i bianchi risultati mentre sia preservante l'interazioni. L'ADNA hè poi alluntanata cù perle stretti è purificate per a preparazione di biblioteca sussegwenti.
Vantaghji di serviziu
Panoramica di Hi-C
(Lieberman-Aiden E et al.,Scienza, 2009)
●Eliminendu a necessità di e dati di pupulazione genetica:Hi-C sustituisce l'infurmazioni essenziali necessarie per u conteg ancoring.
●Densità di u Marker Alta:Pusendu à un ratio di l'anchuring di un altu cuntattu sopra u 90%.
●ESTRAZIONI DI CONPRETISTIVI E Publicazione:Bmkgene hà vasta sperienza cù più di 2000 casi d'Assemblea Hi-C da 1000 spezie sfarenti è diversi patenti. Più di 200 casi publicati anu un fattore impattu accumulativu di più di 2000.
●Squadra di BIOInFormatics altamente qualificati:Cù i parenti in casa è i software di u software per l'esperimenti di dati è di u software di dati di visualizazione autodiputti chì vi permette di bloccu manuale chì si sviluppa, riposendu, riposendu.
●Supportu Post-Vendita:U nostru impegnu si estende al di là di u cumpletu di u prugettu cù un periodu di serviziu dopu à 3 mesi. Durante questu tempu, offremu u seguitu di u prugettu, a risoluzione di prublemi di prublemi, è Q & A sessioni per indirizzà qualsiasi dumande ligate à i risultati.
●Ancutazione cumpleta: Utilizemu basa di dati in modu food à annunzià i geni cù variazioni identificati è l'analisi di arrogazione currenza, furnisce insignamenti prughjetti di ricerca.
Specificazioni di serviziu
| Preparazione di a Biblioteca | Strategia Sequencing | Output di dati cunsigliatu | Cuntrollu di qualità |
| Biblioteca hi-c | Illumina Novasee PEZ50 | 100x | Q30 ≥ 85% |
Esigenze di mostra
| Tissu | Quantità necessaria |
| Viscera d'animali | ≥ 2 g |
| Musculu animale | |
| Sangue Mammalianu | ≥ 2 ml |
| Putile / sangue di pesci | |
| Pianta- foglia fresca | ≥ 3 g |
| Cellula cultura | ≥ 1x107 |
| INSECT | ≥ 2 g |
U flussu di travagliu di serviziu
Design di sperimentariu
Spedizione di mostra
Custruzione di Biblioteca
SEQUENZZA
Analisi di dati
Servizi dopu in vendita
1) dati crudi qc
2) Biblioteca Hi-C: stima di interazzioni hi-c validi
3) Hi-C Assemblea: Cusente di Contigs in Gruppi, seguitate da l'ordine di Contig in ogni gruppu è assignendu l'orientazione Contig
4) Evaluazione Hi-C
Biblioteca Hi-C - stima di e coppie di interazzione valida HI-C
Hi-C Assemblea - Statistiche
Valutazione post-assemblea - u calore di l'intensità di segnu trà i bins
Esplora i avanzati facilitati da i servizii Hi-C di BMKGENE attraversu una cullizzioni curata di publicazioni.
Tian, T. et al. (2023) "disemply di pratica è genome assemblata di un germantente di secca di secca di secca", genetica Natura 2023 55: 3, 55 (3), Pp. 496-506. DOI: 10.1038 / S41588-023-01297-Y.
Wang, zl et al. (2020) "Assemblea di scale cromosoma di l'APISHE ASPIS CERANA Genome ', frontiere in Genetica, 11, p. 524140. DOI: 10.3389 / FGENE.2020.00279 / BIBTEX.
Zhang, F. et al. (2023) 'Evoluzione Evoluzione di Tropane Alkaloid Biosinthesis. Analizendu dui omi in a famiglia Solanceae', a cumunità di a natura 2023 14: 1-14. DOI: 10.1038 / S41467-023-37133-4.
Zhang, x. et al. (2020) 'Genomi di u Wasp Banyan Endri- Peghja trappine Pruconda in A Figlira A Fig (Call, 183 (4), PP. 875-889.217. DOI: 10.1016 / J.CELL.2020.09.043
