Piattaforma | Taglia di biblioteca | Rendimentu di dati teoricu (per cellula) | Precisione di basa | APPLICAZIONI |
NANOPORE | 8kb, 10KB, 20kb, Ultralong, CDN-PCR | 70-90GB / Cell | 85-92% | SB Chjaming, de Novo, sequenza completa, sequenzione di lombata, Iso-Seq, annatazione di gene, disecenza di a o metilazione da DNA |
● Oltre e 5 anni di sperimentata nantu à a piattaforma Pacbio cù migliaia di prughjetti chjusi cun varie spezie.
● BMKGENE hè un cumpagnu ufficiale di Oxford Nanopore, cù una certificazione Dual Platform RNA / DN.
● Ci sò mudelli principali di sequenza cù equipaggiu cumpletu è una provinazione di sequenza suficiente.
● Basatu nantu à a piattaforma nanopore, più di 10 animali è pianta Rinovo RECEARCHES sò stati publicati in ghjurnali di rinnuvati internaziunali.
Tipu di mostra | Quantità | Cuncentretizione (Qubit ®) | Volume | PURITUZA | Altri |
L'abbina genomica | Dipende di u requisitu di dati | ≥20ng / μl | ≥15μl | Od260 / 280 = 1.7-2.2; Od260 / 230 .1.5; Peak Clear à 260 NM, senza contaminazioni | A cuncentrazione deve esse misurata da Qubit è Qubit / Nanopore ≤ 2 |
Rna totale | ≥1.2μg | ≥100μg / μl | ≥15μl | Od260 / 280 = 1,7-2.5; Od260 / 230 = 0.5-2,5; nisuna contaminazioni | Valore di rin ≥7,5 |
Valutazione di qualità di dati di mostra DNA
Tabella 1. Statistiche nantu à e dati puliti.
Bmkid | rlawseqnum | rabtsumbase | CLEANSEQNUM | CLEANSUMASE | CLEANNYLEN | CLIANNESTENEELLI | CLEANTEANLEN | plegnimaLen | CILLEMEANQU |
Dna_bmk01 | 1,218,239 | 26,37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143.181 | 9 |
Valutazione di qualità di dati di a rna mostra
Tabella 1. Statistiche nantu à e dati puliti.
U filenariu | CLIPENID | LEADNUM | Basenu | N50 | Significa | Maxlength | Mediuqscore |
Rna_bmk001 | C2 | 8.947.708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129.227 | Q12 |
Figura 1. Cunsigliu di a Distribuzione Lonna
Figura 2. Distribuzione di puntuazione di qualità di dati puliti
Figura 3. A durata è a distribuzione di score di qualità di dati puliti