Biblioteche predefinite di Illumina
Features
●Piattaforme:Illumina NovaSeq 6000 è NovaSeq X Plus
●Modi di sequenza:PE150 è PE250
●Cuntrolla di qualità di biblioteche prima di sequencing
●Dati di sequenza QC è consegna:consegna di rapportu QC è dati crudi in formatu fastq dopu à demultiplexing è filtru Q30 leghje
Vantaghji di serviziu
●Versatilità di servizii di sequenza:u cliente pò sceglie di sequenza per via, cellula di flussu, o per quantità di dati necessarii (sequenza di corsia parziale).
●Vasta sperienza nantu à a piattaforma di sequenza Illumina:cù millaie di prughjetti chjusi cù diverse spezie.
●Consegna di u rapportu QC di sequenza:cù metrica di qualità, precisione di dati è prestazioni generale di u prughjettu di sequenza.
●Prucessu di sequencing maturu:cù un cortu tempu di turn-around.
●Rigurosu cuntrollu di qualità: implementemu requisiti stretti di QC per guarantisce a consegna di risultati sempre di alta qualità.
Piattaforme di mostra
| Piattaforma | Cellula à flussu | Modu di sequenza | Unità | Pruduzzione stimata |
| NovaSeq X | 10B (8 corsie) | PE150 | Single Lane Lane Parziale | 375 Gb / Lane |
| 25B (8 corsie) | PE150 | Single Lane Lane Parziale | 1000 Gb/Lane | |
| NovaSeq 6000 | Cellule à flux SP (2 voies) | PE250 | Cellula à flussu Single Lane Lane Parziale | 325-400 M leghje / Lane |
| Cellule à flux S4 (4 voies) | PE150 | Cellula à flussu Single Lane Lane Parziale | ~ 800 Gb / Lane |
Requisiti di mostra
| A quantità di dati (X) | Concentrazione (qPCR/nM) | Volume | |
| Sequenza di corsia parziale
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Sequenza di corsia | Per Lane | ≥ 1,5 nM / Pool di biblioteca | ≥ 25 μl / Pool di biblioteca |
In più di a cuncentrazione è a quantità totale, un mudellu di piccu adattatu hè ancu necessariu.
Nota: A sequenza di corsia di biblioteche di bassa diversità richiede PhiX spike-in per assicurà una basa robusta.
Si consiglia di inviare biblioteche pre-agrupate come campioni. Se avete bisognu di BMKGENE per eseguisce un pooling di biblioteche, fate riferimentu à
i requisiti di a biblioteca per a sequenza di corsi parziale.
Dimensione di a Biblioteca (Mappa di punta)
U piccu principale deve esse in 300-450 bp.
I biblioteche duveranu avè un unicu piccu principale, senza contaminazione di l'adattatore è senza dimeri di prima.
Per piacè cuntattateci se i vostri campioni ùn rispondenu micca à i requisiti di materiale di partenza.
U flussu di travagliu di serviziu
Cuntrolu di qualità di a biblioteca
Sequencing
Controlu di qualità di dati
Cunsigliu di prughjettu
Rapportu QC di a biblioteca
Un rapportu nantu à a qualità di a biblioteca hè furnitu prima di a sequenza, a valutazione di a quantità di a biblioteca è a frammentazione.
Rapportu QC di sequenza
Table 1. Statistiche nantu à i dati di sequenza.
| ID di mostra | BMKID | Letture crude | Dati crudi (bp) | Letture pulite (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuzione di qualità à longu leghje in ogni mostra
Figura 2. Distribuzione di cuntenutu di basa
Figura 3. Distribuzione di u cuntenutu di leghje in sequecing data
