CircRNA

Circular RNAs (circRNAs) sò RNAs non codificanti chì formanu strutture circulari è anu parechje roli regulatori, cumpresu cumpetizione cù miRNA per i geni di destinazione è u ligame di proteine. U pipeline BMKCloud circRNA hè pensatu per l'analisi di biblioteche rRNA depleted cun un genoma di riferimentu ben annotatu è di alta qualità. L'analisi principia cù u trimming di lettura è u cuntrollu di qualità, seguitu da l'allineamentu di lettura à u genoma di riferimentu è a prediczione di circRNA novi, accumpagnata da l'identificazione di circRNA cunnisciuti da basa di dati. I target miRNA currispondenti è l'ospiti circRNA sò successivamente identificati. L'analisi di l'espressione differenziale palesa circRNAs espressi di manera differenziale, è l'ospiti currispondenti sò annotati funzionalmente per estrae funzioni biologiche arricchite.