Prokaryotic rna nga niini
Bahin
● Ang pagproseso sa RNA Sample naglangkit sa pag-andam sa RRNA nga gisundan sa pag-andam sa Library RNA Library.
● BioInInformatiformatic nga pag-analisar base sa pag-align sa usa ka reperensya nga genome
● Ang pag-analisar naglakip sa ekspresyon sa gene ug mga deg apan usab sa istruktura nga transcript ug pag-analisar sa SRNA
Mga Buluhaton sa Serbisyo
●Hugot nga kalidad nga Kontrol: Gipatuman namon ang mga puntos sa kontrol sa Core tabok sa tanan nga mga yugto, gikan sa sample ug pag-andam sa Librarya sa pagkasunud ug mga bioinformatics. Kini nga mabinantayon nga pag-monitor nagsiguro sa paghatud sa kanunay nga kalidad nga mga sangputanan.
●Strand-Piho nga Sintainting Data: Tungod sa pag-andam sa Library RNA nga direkta nga direksyon, nga makaila sa pag-ila sa mga transkrip sa anti-diwa.
●Kompleto ang pag-analisa nga gipahiangay sa prokaryotic transcription: Ang bioinformatiformatiformatiformatiformation nga pipeline naglakip dili lamang sa pag-analisar sa ekspresyon sa gene apan usab pag-analisar sa istruktura sa transcript, lakip ang pag-ila sa mga operons, Urss ug promotor. Naglakip usab kini sa pag-analisar sa SRNA, nga mao ang pag-annate ug panagna sa sekundaryong istruktura ug mga target.
●Suporta sa post-sales: Ang among pasalig molapas sa pagkompleto sa proyekto nga adunay 3-bulan nga pagkahuman sa pag-alagad sa serbisyo. Niining panahona, nagtanyag kami sa pag-follow-up sa proyekto, pagsulbad sa tabang, ug Q & usa ka sesyon aron matubag ang bisan unsang mga pangutana nga may kalabutan sa mga sangputanan.
Mga kinahanglanon nga sample ug paghatud
| Laybrari | SEQUENCING SCHATEGY | Girekomenda ang datos | Kinaandan nga Kontrol |
| Ang RRNA mikunhod sa direksyon sa librarya | Illlarina PE150 | 1-2 GB | Q30085% |
Mga Kinahanglan nga Sampol:
| Paghiusa. (NG / μL) | Kantidad (μg) | Kalig-on | Kaligdong |
| ≥ 50 | ≥ 1 | Od260 / 280 = 1.8-2.0 Od260 / 230 = 1.0-2.5 Limitado o wala'y kontaminasyon sa protina o DNA nga gipakita sa gel. | Rin≥6.5 |
Girekomenda nga Sample nga Paghatud
Sudlanan: 2 ml centrifuge tube (Tin Foil dili girekomenda)
Sample nga labeling: Group + replicling eg A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pagpadala:
1. Ang uga nga yelo: Ang mga sample kinahanglan nga maputos sa mga bag ug gilubong sa uga nga yelo.
2. RNANASTITU PUBES: Ang mga sample sa RNA mahimong mamala sa RNA stabilization tube (eg rnastable®) ug gipadala sa temperatura sa kwarto.
Pag-agos sa Pag-alagad
Sample nga Paghatud
Pagtukod sa Library
Sunud-sunod
Data Analysis
Pagkahuman sa mga serbisyo nga gibaligya
BioInInformatic nga pag-analisa sa bioinformatiform
Naglakip sa mosunod nga pag-analisar:
● HARW DATAD SA DATALION COLLOCT
● Pag-align sa genome genome
● Pagsusi sa kalidad sa Librarya: RNA FIRMENTALION SA PAGSULAY, I-insert ang gidak-on ug pagsunud sa saturation
● Pag-anikal nga anotasyon sa gitagna nga mga coding gen
● Pag-analisar sa ekspresyon: Pag-analisar ug panguna nga pag-analisar sa sangkap (PCA)
● Pagkalainlain nga ekspresyon sa gene (deg)
● Functional Annotation ug pagpalambo sa mga deg
● Pag-analisa sa SrNA: Prediction, annotation, Target, ug Secondary Strats Strats Stratal Prediksyon
● Pag-analisar sa istruktura sa istruktura: mga operon, sugod ug pagtapos sa mga posisyon, dili mabag-o nga rehiyon (UTS), promoter, ug pag-analisar sa SNP / SNP / SNP / SNP / SNP / SNP / SNP / SNP / SNP / SNP / SNP / INDED / SNP / INDED / INDEL / INDED / INDED / INDED / INDED / INDEL / INDED / INDED / INDEL / INDEL / INDED / INDED / INDED / INDEL / INDED / INDED / INDED / INDEL / INDEL / INDEL / INDEL / INDED / INDEL / INDED / INDED / INDEL / IndEL ANALAY
Pagsunud sa Saturation
Functional Annotation sa mga coding gen
Correlation tali sa mga sampol
Ang mga gipahayag nga mga gipahayag nga mga gene (degs) nga pag-analisar
Ang pag-analisar sa pagpalambo sa pagpalambo
SRNA Annotation
Susihon ang mga kauswagan nga gipadali sa Nanopore sa Bmkgene Full-Length nga mga serbisyo sa MRNA sa kini nga gipakita nga publikasyon.
Guan, CP et al. .Polish Journal sa Microbiology, 67 (2), p. 223. DOI: 10.21307 / PJM-2018-024.
