-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Ang spatial transcriptomics nag-una sa siyentipikong kabag-ohan, nga naghatag gahum sa mga tigdukiduki sa pagsusi sa makuti nga mga pattern sa ekspresyon sa gene sulod sa mga tisyu samtang gipreserbar ang ilang spatial nga konteksto. Taliwala sa lain-laing mga plataporma, ang BMKGene nakamugna sa BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, nga gipasigarbo ang gipausbaw nga resolusyon sa 3.5µm, nakaabot sa subcellular range, ug nakapahimo sa multi-level resolution settings. Ang S3000 chip, nga adunay gibana-bana nga 4 ka milyon nga mga lugar, naggamit sa mga microwell nga gipatong sa mga beads nga puno sa mga spatially barcoded capture probes. Usa ka librarya sa cDNA, nga gipadato sa mga spatial barcode, giandam gikan sa S3000 chip ug pagkahuman gisunod sa plataporma sa Illumina NovaSeq. Ang kombinasyon sa spatially barcoded samples ug UMIs nagsiguro sa katukma ug specificity sa datos nga namugna. Ang BMKManu S3000 chip's hilabihan ka daghag gamit, nga nagtanyag sa multi-level nga mga setting sa resolusyon nga mahimong maayong pagkahan-ay sa lain-laing mga tisyu ug gitinguha nga lebel sa detalye. Kini nga adaptability nagbutang sa chip isip usa ka talagsaon nga pagpili alang sa nagkalain-laing spatial transcriptomics nga mga pagtuon, pagsiguro sa tukma nga spatial clustering nga adunay gamay nga kasaba. Ang paggamit sa teknolohiya sa cell segmentation uban sa BMKManu S3000 makapahimo sa delimitation sa transcriptional data ngadto sa mga utlanan sa mga selula, nga miresulta sa usa ka pagtuki nga adunay direkta nga biological nga kahulogan. Dugang pa, ang gipaayo nga resolusyon sa S3000 nagresulta sa mas taas nga gidaghanon sa mga gene ug UMI nga nakit-an matag cell, nga nakapahimo sa usa ka labi ka tukma nga pagtuki sa mga pattern sa spatial nga transkripsyon ug pag-cluster sa mga selula.
-
Usa ka nuclei RNA Sequencing
Ang pagpalambo sa single-cell capture ug custom library construction techniques, inubanan sa high-throughput sequencing, nakapabag-o sa gene expression studies sa cell level. Kini nga kauswagan nagtugot alang sa mas lawom ug mas komprehensibo nga pagtuki sa komplikadong mga populasyon sa selula, pagbuntog sa mga limitasyon nga nalangkit sa aberids nga ekspresyon sa gene sa tanang mga selula ug pagpreserbar sa tinuod nga heterogeneity sulod niini nga mga populasyon. Samtang ang single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) adunay dili ikalimod nga mga bentaha, nakasugat kini og mga hagit sa pipila ka mga tisyu diin ang paghimo sa usa ka single-cell suspension napamatud-an nga lisud ug nanginahanglan mga bag-ong sample. Sa BMKGene, among gitubag kini nga babag pinaagi sa pagtanyag og single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) gamit ang state-of-the-art nga 10X Genomics Chromium nga teknolohiya. Kini nga pamaagi nagpalapad sa spectrum sa mga sample nga madawat sa transcriptome analysis sa single-cell level.
Ang pag-inusara sa nuclei nahimo pinaagi sa bag-ong 10X Genomics Chromium chip, nga adunay walo ka channel nga microfluidics nga sistema nga adunay doble nga pagtabok. Sulod niini nga sistema, ang gel beads nga naglakip sa barcodes, primers, enzymes, ug usa ka nucleus gisulod sa nanoliter-sized nga oil drops, nga nahimong Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Pagsunod sa GEM formation, cell lysis ug barcode release mahitabo sulod sa matag GEM. Pagkahuman, ang mga molekula sa mRNA moagi sa reverse transcription sa mga cDNA, nga gilakip ang 10X barcode ug Unique Molecular Identifiers (UMIs). Kini nga mga cDNA gipailalom sa standard sequencing library construction, nga nagpadali sa usa ka lig-on ug komprehensibo nga eksplorasyon sa mga gene expression profile sa single-cell level.
Platform: 10 × Genomics Chromium ug Illumina NovaSeq Platform
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Ang spatial transcriptomics usa ka cutting-edge nga teknolohiya nga nagtugot sa mga tigdukiduki sa pag-imbestigar sa mga pattern sa ekspresyon sa gene sulod sa mga tisyu samtang gipreserbar ang ilang spatial nga konteksto. Usa ka kusgan nga plataporma sa kini nga domain mao ang 10x Genomics Visium inubanan sa pagsunud sa Illumina. Ang prinsipyo sa 10X Visium naa sa usa ka espesyal nga chip nga adunay gitudlo nga lugar nga makuha kung diin gibutang ang mga seksyon sa tisyu. Kini nga lugar sa pagkuha adunay mga barcoded spot, ang matag usa katumbas sa usa ka talagsaon nga spatial nga lokasyon sa sulod sa tisyu. Ang nakuha nga mga molekula sa RNA gikan sa tisyu dayon gimarkahan nga adunay talagsaon nga mga molekular nga identifier (UMI) sa panahon sa proseso sa reverse transcription. Kini nga mga barcoded spots ug UMIs makahimo sa tukma nga spatial mapping ug quantification sa gene expression sa usa ka single-cell nga resolusyon. Ang kombinasyon sa spatially barcoded samples ug UMIs nagsiguro sa katukma ug specificity sa datos nga namugna. Pinaagi sa paggamit niining Spatial Transcriptomics nga teknolohiya, ang mga tigdukiduki makaangkon og mas lawom nga pagsabot sa spatial nga organisasyon sa mga selula ug sa komplikadong mga interaksyon sa molekula nga nahitabo sulod sa mga tisyu, nga naghatag ug bililhong mga pagsabot sa mga mekanismo nga nagpahiping biological nga mga proseso sa daghang natad, lakip na ang oncology, neuroscience, developmental biology, immunology. , ug botanikal nga pagtuon.
Plataporma: 10X Genomics Visium ug Illumina NovaSeq
