-
Comparative Genomics
Ang comparative genomics naglakip sa pagsusi ug pagtandi sa tibuok genome sequence ug istruktura sa lain-laing mga espisye. Kini nga natad nagtinguha sa pagpadayag sa ebolusyon sa mga espisye, pag-decode sa mga function sa gene, ug pagpatin-aw sa genetic regulatory mechanisms pinaagi sa pag-ila sa gitipigan o divergent sequence structures ug mga elemento sa lain-laing mga organismo. Ang usa ka komprehensibo nga pagtandi nga pagtuon sa genomics naglangkob sa mga pag-analisar sama sa mga pamilya sa gene, pag-uswag sa ebolusyon, mga panghitabo sa pagdoble sa tibuuk nga genome, ug ang epekto sa mga pinili nga pagpamugos.
-
Ebolusyonaryong Genetika
Ang populasyon ug ebolusyonaryong plataporma sa pag-analisa sa genetic natukod base sa daghang kasinatian nga naipon sulod sa BMK R&D team sulod sa mga katuigan. Kini usa ka himan nga mahigalaon sa tiggamit labi na alang sa mga tigdukiduki nga wala mag-mayor sa bioinformatics. Kini nga plataporma nagtugot sa batakang ebolusyonaryong genetics nga may kalabutan sa batakang pagtuki lakip na ang phylogenetic tree construction, linkage disequilibrium analysis, genetic diversity assessment, selective sweep analysis, kinship analysis, PCA, population structure analysis, etc.
-
Hi-C Based Genome Assembly
Ang Hi-C usa ka pamaagi nga gidisenyo aron makuha ang chromosome configuration pinaagi sa paghiusa sa probing proximity-based nga interaksyon ug high-throughput sequencing. Ang intensity niini nga mga interaksyon gituohan nga negatibo nga may kalabutan sa pisikal nga gilay-on sa mga chromosome. Busa, ang Hi-C nga datos gigamit sa paggiya sa pag-cluster, pag-order, ug pag-orient sa mga assembled sequence sa usa ka draft genome ug pag-angkla niadtong sa usa ka piho nga gidaghanon sa mga chromosome. Kini nga teknolohiya naghatag gahum sa usa ka chromosome-level genome assembly kung wala ang usa ka mapa sa genetic nga nakabase sa populasyon. Ang matag genome nanginahanglan usa ka Hi-C.
-
Pagsunodsunod sa Genome sa Tanum/Animal De Novo
De NovoAng sequencing nagtumong sa pagtukod sa tibuok genome sa usa ka espisye gamit ang mga teknolohiya sa sequencing kung walay reference genome. Ang pagpaila ug kaylap nga pagsagop sa ikatulo nga henerasyon nga pagsunud-sunod, nga adunay mas taas nga mga pagbasa, labi nga nakapauswag sa genome nga asembliya pinaagi sa pagdugang sa pagsapaw taliwala sa mga pagbasa. Ang kini nga pag-uswag labi ka hinungdanon kung mag-atubang sa mga mahagiton nga genome, sama sa mga nagpakita sa taas nga heterozygosity, taas nga ratio sa nagbalik-balik nga mga rehiyon, polyploid, ug mga rehiyon nga adunay nagbalik-balik nga mga elemento, dili normal nga sulud sa GC, o taas nga pagkakomplikado nga kasagaran dili maayo nga natipon gamit ang mubo nga pagbasa nga pagkasunod-sunod. nag-inusara.
Ang among one-stop nga solusyon naghatag ug integrated sequencing services ug bioinformatic analysis nga naghatag ug de-kalidad nga de novo assembled genome. Usa ka inisyal nga survey sa genome uban sa Illumina naghatag ug mga banabana sa gidak-on ug kakomplikado sa genome, ug kini nga impormasyon gigamit sa paggiya sa sunod nga lakang sa dugay na nga pagbasa nga pagkasunodsunod sa PacBio HiFi, gisundan sade novoasembliya sa contigs. Ang sunod nga paggamit sa HiC nga asembliya makapahimo sa pag-angkla sa mga contigs sa genome, nga makakuha og chromosome-level assembly. Sa katapusan, ang genome gi-annotate pinaagi sa pagtagna sa gene ug pinaagi sa pagsunud sa gipahayag nga mga gene, nga gigamit ang mga transcriptome nga adunay mubo ug taas nga pagbasa.
-
Tawo nga Tibuok Exome Sequencing
Ang Human Whole exome sequencing (hWES) kaylap nga giila isip usa ka cost-effective ug gamhanan nga sequencing approach para sa pagtino sa mutation nga hinungdan sa sakit. Bisan pa nga naglangkob lamang sa mga 1.7% sa tibuok genome, ang mga exon adunay importante nga papel pinaagi sa direktang pagpakita sa profile sa kinatibuk-ang function sa protina. Ilabi na, sa genome sa tawo, labaw sa 85% sa mga mutasyon nga may kalabutan sa mga sakit nga makita sa sulod sa mga rehiyon sa pag-coding sa protina. Nagtanyag ang BMKGENE og usa ka komprehensibo ug flexible nga serbisyo sa pagsunud sa exome sa tawo nga adunay duha ka lainlaing mga estratehiya sa pagkuha sa exon nga magamit aron makab-ot ang lainlaing mga katuyoan sa panukiduki.
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Ang high-throughput genotyping, ilabina sa dagkong populasyon, maoy sukaranang lakang sa genetic association studies ug naghatag ug genetic nga basehan para sa functional gene discovery, evolutionary analysis, ug uban pa. Imbes sa lawom nga tibuok genome re-sequencing,Gipakunhod ang Representasyon sa Genome Sequencing (RRGS)sagad gigamit sa kini nga mga pagtuon aron maminusan ang pagsunud sa gasto sa matag sample samtang gipadayon ang makatarunganon nga kahusayan sa pagdiskobre sa genetic marker. Nakab-ot kini sa RRGS pinaagi sa paghilis sa DNA nga adunay mga restriction enzymes ug pagtutok sa usa ka piho nga gidak-on sa gidak-on sa tipik, sa ingon nagsunud-sunod lamang sa usa ka tipik sa genome. Taliwala sa lainlain nga mga pamaagi sa RRGS, ang Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF) usa ka napasadya ug taas nga kalidad nga pamaagi. Kini nga pamaagi, nga gihimo nga independente sa BMKGene, nag-optimize sa restriction enzyme nga gitakda alang sa matag proyekto. Gipaneguro niini ang pagmugna og daghang ihap sa mga tag sa SLAF (400-500 bps nga mga rehiyon sa genome nga gisunod-sunod) nga parehas nga giapod-apod sa tibuuk nga genome samtang epektibo nga naglikay sa nagbalikbalik nga mga rehiyon, sa ingon nagsiguro sa labing kaayo nga pagdiskobre sa genetic marker.
-
Illumina pre-made nga mga librarya
Ang teknolohiya sa pagsunud sa Illumina, pinasukad sa Sequencing by Synthesis (SBS), usa ka global nga gisagop nga kabag-ohan sa NGS, responsable sa pagmugna sa kapin sa 90% sa datos sa pagkasunod-sunod sa kalibutan. Ang prinsipyo sa SBS naglakip sa imaging fluorescently labeled reversible terminators samtang ang matag dNTP gidugang, ug pagkahuman gibuak aron tugotan ang paglakip sa sunod nga base. Uban sa tanang upat ka mabalikbalik nga terminator-bound dNTPs nga anaa sa matag sequencing cycle, ang natural nga kompetisyon makapamenos sa bias sa incorporation. Kining daghag gamit nga teknolohiya nagsuporta sa single-read ug paired-end nga mga librarya, nga nag-catering sa lain-laing mga genomic nga aplikasyon. Ang high-throughput nga kapabilidad ug precision sa Illumina sequencing nagpahimutang niini isip usa ka batong pamag-ang sa panukiduki sa genomics, nga naghatag gahum sa mga siyentipiko sa paghubad sa mga kakuti sa mga genome nga adunay dili hitupngan nga detalye ug kahusayan.
Ang among pre-made library sequencing service makapahimo sa mga kustomer sa pag-andam sa sequencing nga mga librarya gikan sa lain-laing mga tinubdan (mRNA, tibuok genome, amplicon, 10x library, ug uban pa). Pagkahuman, kini nga mga librarya mahimong ipadala sa among mga sequencing center alang sa pagkontrol sa kalidad ug pagsunud sa mga platform sa Illumina.
