Bmkcloud log sa

Kusog nga Mga Tool sa Pagtuki

wps_doc_13

Helpmap

Ang Heatmap Tool nagdawat usa ka file nga datos sa matrix nga pag-input ug nagtugot sa mga tiggamit nga ma-filter, normalize ug cluster data. Ang nag-unang kaso sa paggamit alang sa mga heatmaps mao ang cluster analysis sa lebel sa ekspresyon sa gene tali sa lainlaing mga sample.

 

wps_doc_14

KENEEN Annotation

Ang Hene Annotation Tool nagpahigayon sa annotation sa gene base sa sunud-sunod nga pag-align sa mga file sa Fasta Fasta batok sa lainlaing mga database.

wps_doc_15

Sukaranan nga Tool sa Pagpangita sa Lokal nga Pag-align (Blast)

Ang Blast Tool usa ka bersyon sa BMKCloud nga nahugno sa BMBI nga pagbuto ug mahimong gamiton aron mahimo ang parehas nga mga gimbuhaton gamit ang datos nga gi-upload sa account sa BMKCLOUL.

wps_doc_16

CDS_UTR PRIDIKO

Ang himan sa CDS_utR nga giplano nga himan aron matagna ang mga rehiyon sa coding (CDS) ug mga non-coding nga mga rehiyon sa transcript

wps_doc_17

Manhattan Plot

Ang Manhattan Plot Tool nakapahimo sa pagpakita sa taas nga sample nga mga eksperimento ug sagad nga gigamit sa mga pagtuon sa genome-halapad nga Association (GWAS).

wps_doc_18

Diagram sa Circos

Ang tool sa diagram sa sirksyon naghatag og episyente nga pagtan-aw kung giunsa ang pag-apod-apod sa genomic nga bahin sa genome. Ang sagad nga mga bahin naglakip sa kantidad nga loci, snps, indels, istruktura ug pagkopya sa numero sa numero.

wps_doc_19

Ang Ontology sa Gene Ontology (Go) Enrichment

Ang Tool nga Pagpadako sa Pag-uswag naghatag sa pag-analisar sa pagpalambo sa pagpalambo. Ang nag-unang software sa kini nga himan mao ang package nga Topgo-Bioconductor, nga naglakip sa pag-analisar sa ekspresyon nga pagpahayag, pag-analisar sa pagpalambo sa mga resulta.

wps_doc_20

Ang gibug-aton nga gene co-expression network Analysis (WGCNA)

Ang WGCNA usa ka kaylap nga gigamit nga pamaagi sa pagmina sa datos alang sa pagdiskubre sa mga module sa pre-expression. Kini magamit sa lainlaing mga datos sa ekspresyon lakip ang Microarray ug NGS Gene Expression Data.

wps_doc_17

Interproscan

 Ang Tool sa Interproscan naghatag sa pag-analisar sa protina sa protina sa protina ug pag-klasipikasyon.

 

wps_doc_21

Go KEGG Pagpalambo

Ang Go Kegg Enrichment Tool mao ang laraw aron makamugna ang usa ka histogram sa pagpalambo sa pagpalambo, Kongg pagpalambo sa kasaysayan nga gibase sa usa ka gihatag nga tanum nga gitakda ug katugbang nga anotasyon.

Pagkuha usa ka kinutlo

Isulat ang imong mensahe dinhi ug ipadala kini kanamo

Ipadala ang imong mensahe sa amon: