Nanopore Full-Held Transcriptome

Ang Nanopore Transliplume nga Sintaincome usa ka kusog nga pamaagi alang sa pagsunud sa tibuuk nga mga CDNA, nga tukma nga nagpaila ug pag-ihap sa mga isoform sa transcripts. Ang BMKCloud Nanopore nga bug-os nga transcriptokume pipeline gidisenyo aron ma-analisar ang datos sa RNA-SEQ batok sa usa ka taas nga lebel nga gi-anunsyo ug pag-analisar sa kwalipikasyon ug pag-analisar sa gene ug transcript. Pagkahuman sa kalidad nga pagkontrol sa kalidad, ang tibuuk nga mga sunud-sunod nga mga sunud-sunod nga chimeric (flnc) nakuha ug pag-uyon sa mga sunud-sunod nga mapa sa genome nga genome. Gikan sa kini nga set sa transcript, ang ekspresyon mao ang pag-ihap ug ang gipahayag nga mga gipahayag nga mga gene ug transkrip nga gipaila ug functionally annotated. Ang pipeline usab naglakip sa alternatibo nga pag-analisar sa Polyadenity (APA), alternatibong pag-analisar sa Splicing (CDR), CDS), CDS), CDS ug functional annotation sa mga transkrip.