Exclusive Agency for Korea

Bmkcloud log sa

Mga produkto

Kumusta-C nga nakabase sa chromatin interaksyon

HI-C nga nakabase sa chromatin interaction nga gipunting nga imahe

Ang Hi-C usa ka pamaagi nga gidisenyo aron makuha ang pagsulud sa genomic pinaagi sa paghiusa sa mga interaksiyon nga gipasukad sa proximity-based. Ang pamaagi gibase sa chromatin crosslinking uban ang Formaldehyde, gisundan sa pagtunaw ug re-liggi sa usa ka paagi nga ang mga tipik nga adunay mga produkto nga lig-on lamang ang migsama nga mga produkto nga lig-on. Pinaagi sa pagsunud niini nga mga produkto sa Ligation, posible nga tun-an ang 3D organisasyon sa genome. Ang HI-C nagtugot sa pagtuon sa pag-apod-apod sa mga bahin sa genome nga gaan nga giputos (usa ka kompartamento, euchromatin) ug labi pa nga labi ka ma-aktibo, ug ang mga rehiyon nga labi ka maayo nga giputos (b compartments, heterochromatin). Hi-C can also be used to pinpoint Topologically Associated Domains (TADs), regions of the genome that have folded structures and are likely to have similar expression patterns, and to identify chromatin loops, DNA regions that are anchored together by proteins and that are kanunay nga gipauswag sa mga elemento sa regulasyon. Ang sunud-sunod nga serbisyo sa BMKGENE nga serbisyo naghatag gahum sa mga tigdukiduki nga mag-explore sa mga spatial nga sukat sa genomics, pag-abli sa mga bag-ong agianan alang sa pagsabut sa genome nga regulasyon ug sakit.

Kontaka kami

Mga Detalye sa Serbisyo

Bioinformatics

Mga resulta sa Demo

Gipili nga Publikasyon

Mga Tampok sa Serbisyo

● Pagsunud sa Illamina Novasq nga adunay PE150.

● Ang serbisyo nanginahanglan mga sample sa tisyu, imbis nga makuha ang mga nucleic acid, aron ma-cross-link sa Formaldehyde ug mapreserbar ang mga interaksyon sa DNA-protina.

● Ang pag-eksperimento sa Hi-C naglangkit sa pagdili ug pagtapos sa pag-ayo sa mga sticky nga natapos sa Biotin, nga gisundan sa pagkubkob sa mga nag-away nga mga interaksyon. Ang DNA dayon gibira sa mga streptavidin kuwarta ug gihinloan alang sa sunod nga pag-andam sa librarya.

Mga Buluhaton sa Serbisyo

●Ang kamalaumon nga pagdili sa pagdili sa enzyme: Aron masiguro ang usa ka taas nga hi-c nga pagkaepektibo sa lainlaing mga species nga adunay 93% nga balido nga mga pares sa pakig-uban.

●Daghang kahanas ug mga rekord sa publikasyon:Ang BMKGENE adunay daghang kasinatian sa> 2000 Hi-C nga mga proyekto gikan sa 800 nga lainlaing mga species ug lainlaing mga patente. Kapin sa 100 nga gipatik nga mga kaso nga adunay usa ka natipon nga epekto nga hinungdan sa kapin sa 900.

●Talagsaon kaayo nga Bioinformatics Team:Sa mga patente sa balay ug software nga mga copyright alang sa mga pag-eksperimento sa Hi-C ug data sa pag-analisar sa kaugalingon ug pag-uswag sa software sa data sa visualization.

●Suporta sa Post-Sales:Ang among pasalig molungtad pa sa pagkompleto sa proyekto nga adunay 3-bulan nga pagkahuman sa pag-alagad sa serbisyo. Niining panahona, nagtanyag kami sa pag-follow-up sa proyekto, pagsulbad sa tabang, ug Q & usa ka sesyon aron matubag ang bisan unsang mga pangutana nga may kalabutan sa mga sangputanan.

●Comprehensive Annotation: Gigamit namon ang daghang mga database aron mapalambo ang mga gene nga adunay giila nga mga kalainan ug ipahigayon ang katugbang nga pag-analisar sa pagpalambo, nga naghatag mga panan-aw sa daghang mga proyekto sa panukiduki.

Mga Estudyante sa Serbisyo

Laybrari

SEQUENCING SCHATEGY

Girekomenda nga Output sa Data

Hi-C signal nga resolusyon

Kumusta-C Library

Illlarina PE150

Chromatin loop: 150x

Tad: 50x

Chromatin Loop: 10KB

TAD: 40KB

Mga kinahanglanon sa serbisyo

Sample Type	Gikinahanglan nga kantidad
Tisyu sa hayop	≥2g
Bug-os nga dugo	≥2ml
Fungi	≥1G
Tanum nga Punoan	1g / aliquot, 2-4 nga mga aliquote girekomenda
Mga Sulud nga CLELS	≥1x10⁷

Kaniadto: TGUIDE SMART MANNET Plant Plant RNA KIT

Sunod: Ang mga librarya sa DNBSEQ naghimo sa mga librarya

Naglakip sa mosunod nga pag-analisar:

● hilaw nga datos qc;

● Pag-mapping ug Hi-C Library QC: balido nga mga pares sa interaction ug interaction nga pagkadunot nga mga exponents (IDes);

● Propesyon sa pakig-uban sa genome: CIS / TRANS ANALRASYON UG HI-C Pakigsulti sa Pakigsulti;

● Pag-apod-apod sa pag-apod-apod sa kompartimento sa usa ka / B;

● Pag-ila sa mga tads ug chromatin nga mga loops;

● Pagkalainlain nga pag-analisar sa 3D chromatin nga mga elemento sa istruktura sa mga sample ug katugbang nga pag-annate sa pag-annot sa mga kauban nga gene.

Cis ug pag-apod-apod sa proporsyon

Heatmap sa mga interomosa nga pakig-uban sa mga sample

Ang pag-apod-apod sa genome sa usa ka compartments

Ang pag-apod-apod sa genome sa chromatin

Pagtan-aw sa Tads

Susihon ang mga pag-uswag sa panukiduki nga gipadali sa mga serbisyo nga hi-c sa BMKGENE sa usa ka curate nga koleksyon sa mga publikasyon.

Meng, T. et al. (2021) 'Usa ka pagtandi nga integrated nga pag-analisar sa multi-omics nga nagpaila sa CA2 ingon usa ka target sa nobela alang sa chordoma',Neuro-oncology, 23 (10), p. 1709-1722. DOI: 10.1093 / NEUOONC / NOB156.

XU, L. ATON AL. (2021) '3D Disorganization sa genome naghatag mga panan-aw sa mga pathogenesis sa Nafld pinaagi sa integrated hi-c, nanopore, ug rna nga niini'ACTA PHARMACEUCAICICA SINICA B, 11 (10), p. 3150-3164. DOI: 10.1016 / J.APSB.2021.03.022.