Pagtuki sa Genome-wide Association
Daloy sa trabaho
Mga Bentaha sa Serbisyo
●Daghang Eksperto ug mga rekord sa publikasyon: uban ang natigom nga kasinatian sa GWAS, ang BMKGene nakakompleto sa gatusan ka mga proyekto sa espisye sa populasyon nga panukiduki sa GWAS, mitabang sa mga tigdukiduki sa pagmantala ug labaw sa 100 ka mga artikulo, ug ang kumulative impact factor miabot sa 500.
● Komprehensibo nga pagtuki sa bioinformatics: workflow naglakip sa SNP-trait association analysis, naghatud ug set sa mga kandidato nga genes ug ang ilang katugbang nga functional annotation.
●Taas nga hanas nga bioinformatics team ug mubo nga siklo sa pagtuki: uban ang maayong kasinatian sa advanced genomics analysis, ang BMKGene's team naghatod ug komprehensibo nga pagtuki uban sa paspas nga turnaround time.
●Suporta sa Post-Sales:Ang among pasalig labaw pa sa pagkompleto sa proyekto nga adunay 3 ka bulan nga pagkahuman sa pagbaligya nga panahon sa serbisyo. Niining panahona, nagtanyag kami nga pag-follow-up sa proyekto, tabang sa pag-troubleshoot, ug mga sesyon sa Q&A aron matubag ang bisan unsang mga pangutana nga may kalabotan sa mga resulta.
Mga detalye ug kinahanglanon sa serbisyo
| Uri sa pagkasunodsunod | Girekomenda nga sukod sa populasyon | Estratehiya sa pagkasunodsunod | Mga kinahanglanon sa nucleotide |
| Tibuok Genome Sequencing | 200 nga mga sample | 10x | Konsentrasyon: ≥ 1 ng/µL Kinatibuk-ang kantidad≥ 30ng Limitado o walay pagkadaot o kontaminasyon |
| Piho nga Locus Amplified Fragment (SLAF) | Ang giladmon sa tag: 10x Gidaghanon sa mga tag: <400 Mb: Girekomenda ang WGS <1Gb: 100K nga mga tag 1Gb > 2Gb: 300K nga mga tag Max 500k nga mga tag | Konsentrasyon ≥ 5 ng/µL Kinatibuk-ang kantidad ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Agarose gel: wala o limitado nga pagkadaot o kontaminasyon
|
Pagpili sa Materyal
Nagkalainlain nga barayti, subspecies, landraces/genebanks/mixed nga mga pamilya/wild resources
Nagkalainlain nga mga lahi, subspecies, landraces
Half-sib nga pamilya/full-sib nga pamilya/wild resources
Daloy sa Trabaho sa Serbisyo
Eksperimento nga disenyo
Sample nga paghatod
Pagkuha sa RNA
Pagtukod sa librarya
Pagsunodsunod
Pagtuki sa datos
After-sale nga serbisyo
Naglakip sa mosunod nga pagtuki:
- Pag-analisar sa asosasyon sa genome: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM nga modelo
- Functional nga anotasyon sa mga gene sa kandidato
Pag-analisar sa asosasyon sa SNP-trait - laraw sa Manhattan
Pag-analisar sa asosasyon sa SNP-trait - laraw sa QQ
Susihon ang mga pag-uswag nga gipadali sa mga serbisyo sa de GWAS sa BMKGene pinaagi sa usa ka curated nga koleksyon sa mga publikasyon:
Lv, L. ug uban pa. (2023) 'Pagsabut sa genetic nga basehan sa ammonia tolerance sa razor clam Sinonovacula constricta pinaagi sa genome-wide association study',Aquaculture, 569, p. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. ug uban pa. (2022) 'Multi-omics nga pag-analisar sa 398 foxtail millet accessions nagpadayag sa genomic nga mga rehiyon nga may kalabutan sa domestication, metabolite traits, ug anti-inflammatory effects',Molekular nga Tanum, 15(8), pp. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. ug uban pa. (2022) 'Genome-Wide Association Mapping sa Hulless Barely Phenotypes sa Drought Environment',Mga utlanan sa Plant Science, 13, p. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. ug uban pa. (2021) 'GmST1, nga nag-encode sa usa ka sulfotransferase, naghatag resistensya sa soybean mosaic virus strains G2 ug G3',Plant, Cell ug Environment, 44(8), pp. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
