DNBSEQ pre-made nga mga librarya
Mga bahin
●Plataporma:MGI-DNBSEQ-T7
●Mga paagi sa pagkasunodsunod:PE150
●Pagbalhin sa mga librarya sa Illumina saMGI:makapahimo sa pagkasunodsunod sa taas nga gidaghanon sa datos sa ubos nga gasto.
●Pagkontrol sa kalidad sa mga librarya sa wala pa ang pagsunud.
●Pagsunud sa datos QC ug pagpadala:paghatud sa QC report ug hilaw nga datos sa fastq format human sa demultiplexing ug pagsala sa Q30 reads.
Mga bentaha
●Pagkadaghan sa mga serbisyo sa Sequencing:ang kustomer mahimong mopili sa pagkasunodsunod pinaagi sa lane o gidaghanon sa datos.
●Taas nga output sa datos:1500 Gb/lane
●Paghatud sa sequencing QC report:nga adunay kalidad nga mga sukatan, katukma sa datos ug kinatibuk-ang pasundayag sa pagsunud-sunod nga proyekto.
●Mature nga proseso sa pagkasunodsunod:uban sa mubo nga turn-around nga panahon.
●Hugot nga Pagkontrol sa Kalidad: gipatuman namo ang higpit nga mga kinahanglanon sa QC aron magarantiya ang paghatud sa makanunayon nga taas nga kalidad nga mga resulta.
Sample nga Kinahanglanon
| Gidaghanon sa Data (X) | Konsentrasyon (qPCR/nM) | Tomo | |
| Partial Lane
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X> 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Usa ka Lane | Per Lane | ≥ 1.5 nM / Library pool | ≥ 25 μl / Library pool |
Dugang sa konsentrasyon ug kinatibuk-ang kantidad, gikinahanglan usab ang angay nga peak pattern.
Mubo nga sulat: Ang pagsunud-sunod sa linya sa mga librarya nga adunay gamay nga kalainan nanginahanglan PhiX spike-in aron masiguro ang lig-on nga base calling.
Among girekomendar ang pagsumite sa mga librarya nga na-pre-pool isip mga sample. Kung gikinahanglan nimo ang BMKGENE sa paghimo sa library pooling, palihog tan-awa ang
mga kinahanglanon sa librarya alang sa partial lane sequencing.
Gidak-on sa Library (Peak nga mapa)
Ang nag-unang peak kinahanglan sulod sa 300-450 bp.
Ang mga librarya kinahanglan nga adunay usa ka punoan nga peak, walay kontaminasyon sa adapter ug walay mga primer dimer.
Pag-alagad sa Trabaho
Library QC report
Ang usa ka taho sa kalidad sa librarya gihatag sa wala pa ang pagsunud-sunod, pagsusi sa kantidad sa librarya, ug pagkabahinbahin.
Pagsunod-sunod sa QC report
Talaan 1. Estadistika sa sequencing data.
| Sample ID | BMKID | Hilaw nga pagbasa | Hilaw nga Data (bp) | Limpyo nga mga pagbasa (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figure 1. Ang kalidad nga pag-apod-apod sa mga pagbasa sa matag sample
Figure 2. Base nga content distribution
Figure 3. Distribusyon sa nabasa nga mga sulod sa sequencing data
