Ang Lightina Pre-Mayo nga mga librarya
Bahin
●Mga Platform:Illumina Novasq 6000 ug NovaseQ x Plus
●Pagsunud sa mga Modelo:Pe150 ug PE950
●Karehanon nga Kontrol sa Librarya sa wala pa moabut
●Pagsunud sa Data QC ug Paghatud:Ang paghatud sa report sa QC ug hilaw nga datos sa format sa FastQ pagkahuman sa demultiplexing ug pagsala sa Q30 mabasa
Mga Buluhaton sa Serbisyo
●Kaarang sa Sentaincing Services:Ang kustomer mahimo nga mopili sa pagkasunud-sunod sa agianan, flow cell, o sa kantidad sa datos nga gikinahanglan (partial lane sequencing).
●Daghang kasinatian sa plataporma sa Illangina:sa libu-libong mga sirado nga mga proyekto nga adunay lainlaing mga espisye.
●Paghatud sa Sentaincing QC Report:nga adunay kalidad nga sukat, katukma sa datos ug kinatibuk-ang pasundayag sa sunud-sunod nga proyekto.
●HINUNGDANONG PAGTUON SA PROSESO:nga adunay mubo nga turn-time.
●Hugot nga kalidad nga Kontrol: Gipatuman namon ang mga kinahanglanon sa QC aron garantiya ang paghatud sa kanunay nga kalidad nga mga sangputanan.
Mga sampol nga mga platform
| Bantawan | Pag-agos sa Cell | SEQUENCECE MODE | Usa | Gibanabana nga output |
| Novasq x | 10b (8 mga agianan) | PE150 | Single lane Partial lane | 375GB / agianan |
| 25b (8 Mga Lanes) | PE150 | Single lane Partial lane | 1000 GB / ALA | |
| Novaseq 6000 | SP Flow Cell (2 Lanes) | PE950 | Pag-agos sa Cell Single lane Partial lane | 325-400 m Reads / Lane |
| S4 flow cell (4 nga mga agianan) | PE150 | Pag-agos sa Cell Single lane Partial lane | ~ 800 GB / ALA |
Mga kinahanglanon nga sample
| Kantidad sa datos (x) | Konsentrasyon (QPCR / NM) | Libro | |
| Parttial Lane Sentaencing
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <X ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <X ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Senta | Matag agianan | ≥ 1.5 Nm / Library Pool | ≥ 25 μl / librarya pool |
Gawas sa konsentrasyon ug kinatibuk-ang kantidad, gikinahanglan usab ang usa ka angay nga pattern sa peak.
Hinumdomi: Ang Senta sa Lane sa LAE sa ubos nga mga librarya nga mga librarya nanginahanglan Phix Spike-In aron masiguro ang lig-on nga pagtawag sa base.
Girekomenda namon ang pagsumite sa mga pre-pooled library ingon mga sample. Kung kinahanglan nimo ang BMKGENE aron makahimo pagpunting sa librarya, palihug tan-awa
Ang mga kinahanglanon sa librarya alang sa partial lane squencing.
Gidak-on sa Librarya (Peak Map)
Ang panguna nga peak kinahanglan nga sa sulod sa 300-450 BP.
Ang mga librarya kinahanglan adunay usa ka panguna nga peak, wala'y kontaminasyon sa adapter ug wala'y mga mag-primer nga mga dimer.
Palihug pag-abot kanamo kung ang imong mga sampol wala magtagbo sa mga kinahanglanon nga materyal nga materyal.
Workflow of Service
Kontrol sa kalidad sa Librarya
Sunud-sunod
Pagdumala sa kalidad sa Data
Paghatud sa proyekto
Taho sa Librarya QC
Ang usa ka taho sa kalidad sa librarya gihatag sa wala pa ang pagkasunud, pagtimbang-timbang sa kantidad sa librarya, ug pagkabungkag.
SEQUENCECING QC report
Table 1. Mga estadistika sa mga datos nga niini.
| Sample ID | Bmkid | RAW nagbasa | Hilaw nga datos (BP) | Limpyo nga Magbasa (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | Bmk_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | Bmk_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Hulagway 1. Ang kalidad nga pag-apod-apod sa tanan nga mga sample
Hulagway 2. Ang pag-apod-apod sa sulud sa sulud
Hulagway 3. Pag-apod-apod sa mga sulud sa pagbasa sa mga datos nga niini
