Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Mga produkto

Tibuok-kadak-an nga MRNA SEQUENCECE -PACBIO

Samtang ang NGS-based MRNA SEQUENCECING usa ka bersyon nga galamiton alang sa pag-ihap sa ekspresyon sa gene, ang pagsalig sa mubo nga pagbasa nagpugong sa paggamit niini sa komplikado nga transcriptomic nga pag-analisar niini. Sa laing bahin, ang sunud-sunod nga PACBIO (ISO-SEQ) naggamit sa dugay na nga teknolohiya sa pagbasa, nga nagtugot sa pagsunud sa tibuuk nga mga transkrip sa MRNA. Kini nga pamaagi nagpadali sa usa ka komprehensibo nga pagsuhid sa alternatibo nga splicing, gene fusions, ug poly-adenylation. Bisan pa, adunay uban pang mga kapilian alang sa pag-ihap sa ekspresyon sa gene tungod sa taas nga kantidad sa datos nga gikinahanglan. Ang teknolohiya sa PACBIO nagsunod sa usa ka molekula, real-time (SMRT) nga sunud-sunod, nga naghatag usa ka lahi nga bentaha sa pagkuha sa tibuuk nga mga transkrip sa MRNA. Ang kini nga kabag-o nga pamaagi naglangkit sa paggamit sa mga zero-mode wavowuides (ZMWs) ug mga microfabricated nga mga atabay nga nakapaarang sa pag-obserbar sa DNA Polymerase nga kalihokan sa panahon sa pagkasunud. Sulod sa kini nga mga ZMWS, ang DNA POlymase sa DNA POLYMELEDS nga usa ka komplikado nga strand sa DNA, nga nagpatungha sa dugay nga pagbasa nga naglibot sa tibuuk nga mga transkrip sa MRNA. Ang operasyon sa PACBIO sa Circular Consensus Sentaincing (CCS) mode nagpalambo sa katukma pinaagi sa balikbalik nga pagsunud sa parehas nga molekula. Ang nakagama nga HIFI nagbasa adunay usa ka katukma nga susama sa NGS, dugang nga nag-ambag sa usa ka komprehensibo ug kasaligan nga pag-analisar sa komplikado nga mga bahin sa transcriptomic.

Platform: Pacbio Sequel II; Pacbio Revio


  • :
  • Mga Detalye sa Serbisyo

    Bioinformatics

    Mga resulta sa Demo

    Gipili nga Publikasyon

    Bahin

    ● CDNA synthesis gikan sa Poly-A mrna nga gisundan sa pag-andam sa Library

    ● Pagsunud sa CCS mode, ang paghimo sa HIFI mabasa

    ● Pagsunud sa tibuuk nga mga transcripts

    ● Ang pag-analisar wala kinahanglana ang usa ka reperensya nga genome; Bisan pa, mahimo kini nga magamit

    ● Ang pag-analisar sa BioInInformatic nakapahimo sa pag-analisar sa mga transkrip sa ISOForm sa LNCRNA, fusions, poly-adenylation, ug istruktura sa gene

    Mga Buluhaton sa Serbisyo

    2

    Taas nga katukma: Ang HIFI mabasa uban ang katukma> 99.9% (Q30), itandi sa ngs

    ● Alternatibong Pag-analisar sa Splicing: Ang pagkasunud sa tibuuk nga mga transkrip nga nagpahimo sa Isoform identification ug kinaiya

    Daghang kahanas: Uban sa usa ka track record sa pagkompleto sa kapin sa 1100 Pacbio Full-Length nga transcriptome nga mga proyekto ug pagproseso sa kapin sa 2300 ka mga sample, ang among koponan nagdala usa ka bahandi sa matag proyekto.

    Suporta sa post-sales: Ang among pasalig molapas sa pagkompleto sa proyekto nga adunay 3-bulan nga pagkahuman sa pag-alagad sa serbisyo. Niining panahona, nagtanyag kami sa pag-follow-up sa proyekto, pagsulbad sa tabang, ug Q & usa ka sesyon aron matubag ang bisan unsang mga pangutana nga may kalabutan sa mga sangputanan.

    Mga kinahanglanon nga sample ug paghatud

    Laybrari

    SEQUENCING SCHATEGY

    Girekomenda ang datos

    Kinaandan nga Kontrol

    Gipalambo ni Polya ang Grna CCS Library

    Pacbio Sequel II

    Pacbio Revio

    20/40 GB

    5/10 M CCS

    Q30085%

    Mga Kinahanglan nga Sampol:

    Nucleotides:

    ● Mga tanum:

    Gamut, stem o petal: 450 mg

    Dahon o liso: 300 mg

    Bunga: 1.2 g

    ● hayop:

    Kasingkasing o tinai: 300 mg

    Viscera o utok: 240 mg

    Kaunoran: 450 mg

    Mga bukog, buhok o panit: 1g

    ● Arthropods:

    Mga insekto: 6g

    Crustacea: 300 mg

    ● bug-os nga dugo: 1 tube

    ● Mga selula: 106 mga selula

     

    Paghiusa. (NG / μL)

    Kantidad (μg)

    Kalig-on

    Kaligdong

    ≥ 100

    ≥ 1.0

    Od260 / 280 = 1.7-2.5

    Od260 / 230 = 0.5-2.5

    Limitado o wala'y kontaminasyon sa protina o DNA nga gipakita sa gel.

    Alang sa mga tanum: Rin≥7.5;

    Alang sa mga hayop: rinto8.0;

    5.06 28s / 18s≥1.0;

    limitado o wala'y basehanan nga kahitas-an

    Girekomenda nga Sample nga Paghatud

    Sudlanan: 2 ml centrifuge tube (wala girekomenda ang Tin Foil)

    Sample nga labeling: Group + replicling eg A1, A2, A3; B1, B2, B3.

    Pagpadala:

    1. Ang uga nga yelo: Ang mga sample kinahanglan nga maputos sa mga bag ug gilubong sa uga nga yelo.

    2. RNANASTITU PUBES: Ang mga sample sa RNA mahimong mamala sa RNA stabilization tube (eg rnastable®) ug gipadala sa temperatura sa kwarto.

    Pag-agos sa Pag-alagad

    Sample QC

    Disenyo sa Pag-eksperimento

    Sample nga Paghatud

    Sample nga Paghatud

    Pag-eksperimento sa piloto

    Pagkuha sa rna

    Pagpangandam sa Library

    Pagtukod sa Library

    Sunud-sunod

    Sunud-sunod

    Data Analysis

    Data Analysis

    Pagkahuman sa mga serbisyo sa pagbaligya

    Pagkahuman sa mga serbisyo nga gibaligya


  • Kaniadto:
  • Sunod:

  • --Pacbio-lang-01

    Naglakip sa mosunod nga pag-analisar:

    ● HARW DATAD SA DATALION COLLOCT

    ● Alternatibong Pagtuki sa Polyadenylation (APA)

    ● Pag-analisa sa transkrip sa fusion

    ● Alternatibong Pag-analisar sa Splicing

    ● Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (Busco) Pag-analisar

    ● Pag-analisa sa Pagbalhin sa Nobela: Prediksyon sa Mga Sunud-sunod sa Coding (CD) ug Pag-anikal nga Annotation

    ● Pag-analisa sa LNCRNA: Prediksyon sa LNCRNA ug Target

    ● Pag-ila sa Microsatemite (SSR)

    Pag-analisar sa busco

     

     图片 26

     

    Alternatibong Pag-analisar sa Splicing

    图片 27

    Alternatibong Pag-analisar sa Polyadenylation (APA)

     

     图片 28

     

    Functional annotation sa mga transcript sa nobela

    图片 29 

    Susihon ang mga kauswagan nga gipadali sa Nanopore sa Bmkgene Full-Length nga mga serbisyo sa MRNA sa kini nga gipakita nga publikasyon.

     

    Ma, Y. et al. (2023) 'pagtandi sa pag-analisar sa Pacbio ug Ont RNA nga mga pamaagi alang sa Nemopilema sa Nomurai Venom Identification', Genomics, 115), p. 110709. DOI: 10.1016 / J.Ygeno.2023.110709.

    Chao, Q. et al. (2019) 'Ang mga dinamika sa pag-uswag sa populus stem transcriptome', magtanum sa biotechnology journal, 17 (1), p. 206-219. Doi: 10.1111 / PBI.12958.

    Deng, H. et al. . 5808. DOI: 10.3390 / IJMS2310580808 / S1.

    Hua, X. et al. . Doi: 10.1038 / S42003-022-03000-Z.

    Liu, M. ATON AL. . 363. DOI: 10.3390 / Mga Insekto14040363 / S1.

    Wang, Lijun et al. . DOI: 10.1186 / S12864-019-5832-9.

    Pagkuha usa ka kinutlo

    Isulat ang imong mensahe dinhi ug ipadala kini kanamo

    Ipadala ang imong mensahe sa amon: