● nga adunay duha nga posible nga mga kapilian nga kapilian sa depende sa gitinguha nga lebel sa pagkompleto sa genome.
● Kapilian sa Draft Genome: Mubo nga pagbasa sa SHEQUENCED kauban ang Illamina Novasq Pe150.
● Kompleto ang 0 Gap Genome.
● Madugay nga pagbasa sa Nanopore Prometyon 48 o Pacbio Revio alang sa genome asembliya.
● Mubo nga pagbasa sa SHELE-Basaha sa Illight Novasq alang sa validation sa genome ug pagtul-id sa sayup (nanopore) o makahimo usa ka draft genome.
●Garantiya ang zero-gap genome: Kini tungod sa pag-apil sa Illangina nga niini nga gisunud sa dugay nga pagbasa sa sunud-sunod nga pagkasunud (nanopore o Pacbio).
●Kompleto nga Bioinformatics Workflow:Naglakip kini sa genome asembliya ug panagna sa daghang mga elemento sa genomic, functional nga anotasyon sa gene, ug genome nga mga panan-aw sama sa plano sa sirkos.
●Daghang kahanas: Uban sa kapin sa 20,000 nga microbial genomes nga nagkatigum, ang BMKGENE nagdala sa usa ka dekada nga kasinatian, usa ka hanas nga pag-analisar sa team, komprehensibo nga suporta sa post-sales.
●Suporta sa Post-Sales:Ang among pasalig molungtad pa sa pagkompleto sa proyekto nga adunay 3-bulan nga pagkahuman sa pag-alagad sa serbisyo. Niining panahona, nagtanyag kami sa pag-follow-up sa proyekto, pagsulbad sa tabang, ug Q & usa ka sesyon aron matubag ang bisan unsang mga pangutana nga may kalabutan sa mga sangputanan.
●Daghang mga Sinugdanan sa Pagsunud nga Anaa:Alang sa lainlaing mga katuyoan sa panukiduki ug mga kinahanglanon sa pagkompleto sa genome.
Pagpangalagad | SEQUENCING SCHATEGY |
Draft genome | Illlarina Pe150 100X |
0 Gap genome | Nanopore 100x + Illightina PE150 100X Or Pacbio Hifi 30x + Illight Pe150 100X (Opsyonal) |
Konsentrasyon (NG / μl) | Total nga kantidad (μg) | Tomo (μL) | Od260 / 280 | Od260 / 230 | |
PACBIO | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
Nanpore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
Ilado | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bacteria: ≥3.5x1010 mga selula
Naglakip sa mosunod nga pag-analisar:
● Pag-ila sa Data nga Kontrol sa Kinaiyahan
● genome nga asembleya
● Pag-analisar sa genome nga sangkap: Prediksyon sa CD ug Daghang mga elemento sa Genomic
● Pag-anik sa Annotation nga adunay daghang mga kinatibuk-an nga database (Go, Kongg, ug Etc) ug Advanced Database (Card, VFDB, ug uban pa)
● Pagpanaw sa ganansya
Gihatagan namon ang genome sa usa ka dali nga ma-access nga format nga Fasta ug ang genome annotation file (GFF).
Gene anotation - Lakaw
KENEEN Annotation - Cazy carbohydrates
Gurome visualization - laraw sa sirkos
Susihon ang mga kauswagan nga gipadali sa mga serbisyo sa asembleya sa BMKGENE
Dai, W. et al. .Internasyonal nga journal sa molekular nga siyensya, 24 (19), p. 14669. DOI: 10.3390 / IJMS241914669 / S1.
Kang, Q. et al. (2021)Pakig-ambit nga ZOology, 16 (6), PP. 798-809. DOI: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Wang, tt et al. .Journal of Biotechnology, 260, p. 38-41. Doi: 10.1016 / J.JBIOTEC.2017.09.001.
Wang, x. et al. .Mga Fronties sa Microbiology, 12, p. 754931. DOI: 10.3389 / FMICM.2021.754931 / BibTex.