Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Mga produkto

16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS

Ang pagsunud-sunod sa Amplicon gamit ang teknolohiya sa Illumina, partikular nga gipunting ang 16S, 18S, ug ITS nga mga marka sa genetic, usa ka kusgan nga pamaagi sa pag-unraveling sa phylogeny, taxonomy, ug kadaghan sa mga espisye sa sulod sa mga komunidad sa microbial. Kini nga pamaagi naglakip sa pagsunud-sunod sa hypervariable nga mga rehiyon sa housekeeping genetic marker. Orihinal nga gipaila ingon usa ka molekular nga fingerprint niWoeses et alsa 1977, kini nga teknik nagbag-o sa microbiome profiling pinaagi sa pagpagana sa isolation-free nga pag-analisar. Pinaagi sa pagkasunodsunod sa 16S (bakterya), 18S (fungi), ug Internal Transcribed Spacer (ITS, fungi), mailhan sa mga tigdukiduki dili lamang ang daghang mga espisye kondili ang mga talagsaon ug wala mailhi. Kaylap nga gisagop isip usa ka importante nga himan, ang amplicon sequencing nahimong instrumento sa pag-ila sa differential microbial compositions sa lain-laing mga palibot, lakip na ang baba sa tawo, mga tinai, stool, ug uban pa.


Mga Detalye sa Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta sa Demo

Gipili nga mga publikasyon

Mga Feature sa Serbisyo

● Sequencing platform: Illumina NovaSeq.

● Pagpadako sa mugbong mga rehiyon sa 16S, 18S ug ITS, ug uban pang mga target sa pagpadako.

● Flexible nga mga pagpili sa amplicon.

● Kasinatian sa miaging proyekto nga adunay daghang target sa pagpadako.

Mga Bentaha sa Serbisyo

Walay pagkahimulag:Paspas nga pag-ila sa komposisyon sa microbial sa mga sample sa kalikopan.

Taas nga Resolusyon: Sa ubos-abunda nga mga sangkap sa environmental sample.

Kaylap nga Magamit: Nagkalainlain nga pagtuon sa komunidad sa microbial.

Komprehensibo nga Bioinformatic Analysis: Ang pinakabag-o nga QIIME2 package (quantitative insight sa microbial ecology) nga adunay lain-laing mga pag-analisa sa termino sa database, annotation, OTU/ASV.

Lapad nga Eksperto: Uban sa 150 ka libo nga amplicon sequencing nga mga proyekto nga gihimo matag tuig, ang BMKGENE nagdala sa kapin sa usa ka dekada nga kasinatian, usa ka hanas kaayo nga grupo sa pagtuki, komprehensibo nga sulod, ug maayo kaayo nga suporta sa post-sales.

Mga Detalye sa Serbisyo

Library

Estratehiya sa Pagsunodsunod

Girekomenda ang datos

Amplicon

Illumina PE250

50/100/300K nga mga tag (Basaha ang mga Pares)

Mga Kinahanglanon sa Serbisyo

Konsentrasyon (ng/µL)

Kinatibuk-ang kantidad (ng)

Tomo (µL)

≥1

≥200

≥20

● Yuta/putik: 1-2g
● Intestinal content-hayop: 0.5-2g
● Intestinal sulod-insekto: 0.1-0.25g
● Ibabaw sa tanom (gipadako nga linugdang): 0.1-0.5g
● Fermentation sabaw enriched sediment): 0.1-0.5g
● Mga hugaw (dagko nga mga mananap): 0.5-2g
● Mga hugaw (ilaga): 3-5 ka lugas
● Pulmonary alveolar lavage fluid: filter nga papel
● Vaginal swab: 5-6 swab
● Panit/genital swab/laway/oral soft tissue/pharyngeal swab/rectal swab: 2-3 swab
● Mga microorganism sa nawong: filter nga papel
● Waterbody/hangin/biofilm: filter nga papel
● Endophytes: 1-2g
● Dental Plaque: 0.5-1g

Daloy sa Trabaho sa Serbisyo

sample delivery

Sample nga paghatod

Pagpangandam sa Library

Pagtukod sa librarya

Pagsunodsunod

Pagsunodsunod

Pagtuki sa datos

Pagtuki sa datos

Human sa pagbaligya Serbisyo

After-sale nga serbisyo


  • Kaniadto:
  • Sunod:

  • 流程图第三版2-01

    Naglakip sa mosunod nga pagtuki:

    • Hilaw nga pagkontrol sa kalidad sa datos
    • OTU clustering /De-noise(ASV)
    • OTU anotasyon
    • Pag-analisar sa pagkalainlain sa Alpha: daghang mga indeks, lakip ang Shannon, Simpson ug ACE.
    • Pagtuki sa pagkalainlain sa Beta
    • Pag-analisar sa taliwala sa grupo
    • Pag-analisa sa correlation: tali sa mga hinungdan sa kalikopan ug komposisyon ug pagkalainlain sa OUT
    • 16S functional gene prediction

    Histogram sa taxonomic distribution

     

    3

     

    taxonomic abundance clustering heat map

    4

     

    Pag-analisar sa pagkalainlain sa Alpha: rarefaction curve

    5

     

    beta diversity analysis: NMDS

    6

     

    Pagtuki sa intergroup: LEFSE biomarker nga pagkadiskobre

    7

     

     

     

    Susihon ang mga pag-uswag nga gipadali sa mga serbisyo sa pagsunud sa amplicon sa BMKGene kauban ang Illumina pinaagi sa usa ka curated nga koleksyon sa mga publikasyon.

    Dong, C. ug uban pa. (2022) 'Assembly, Core Microbiota, ug Function sa Rhizosphere Soil ug Bark Microbiota sa Eucommia ulmoides', Frontiers sa Microbiology, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.

    Li, Y. ug uban pa. (2023) 'Synthetic bacterial consortia transplantation alang sa pagtambal sa Gardnerella vaginalis-induced bacterial vaginosis sa mga ilaga', Microbiome, 11(1), pp. 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y

    Yang, J., Fu, Y. ug Liu, H. (2022) 'Microbiomes sa abug sa hangin nga nakolekta sa panahon sa ground-based closed bioregenerative life support eksperimento "Lunar Palace 365"', Environmental Microbiomes, 17(1), pp. 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.

    Yin, S. ug uban pa. (2022) 'Daghang nagsalig sa feedstock sa mga gene nga magamit nga may kalabotan sa pagbag-o sa nitroheno nga kontrolado nga pagkawala sa nitrogen sa pag-compost', Bioresource Technology, 361, p. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.

    pagkuha og usa ka kinutlo

    Isulat ang imong mensahe dinhi ug ipadala kini kanamo

    Ipadala ang imong mensahe kanamo: