● Sequencing platform: Illumina NovaSeq.
● Pagpadako sa mugbong mga rehiyon sa 16S, 18S ug ITS, ug uban pang mga target sa pagpadako.
● Flexible nga mga pagpili sa amplicon.
● Kasinatian sa miaging proyekto nga adunay daghang target sa pagpadako.
●Walay pagkahimulag:Paspas nga pag-ila sa komposisyon sa microbial sa mga sample sa kalikopan.
●Taas nga Resolusyon: Sa ubos-abunda nga mga sangkap sa environmental sample.
●Kaylap nga Magamit: Nagkalainlain nga pagtuon sa komunidad sa microbial.
●Komprehensibo nga Bioinformatic Analysis: Ang pinakabag-o nga QIIME2 package (quantitative insight sa microbial ecology) nga adunay lain-laing mga pag-analisa sa termino sa database, annotation, OTU/ASV.
●Lapad nga Eksperto: Uban sa 150 ka libo nga amplicon sequencing nga mga proyekto nga gihimo matag tuig, ang BMKGENE nagdala sa kapin sa usa ka dekada nga kasinatian, usa ka hanas kaayo nga grupo sa pagtuki, komprehensibo nga sulod, ug maayo kaayo nga suporta sa post-sales.
Library | Estratehiya sa Pagsunodsunod | Girekomenda ang datos |
Amplicon | Illumina PE250 | 50/100/300K nga mga tag (Basaha ang mga Pares) |
Konsentrasyon (ng/µL) | Kinatibuk-ang kantidad (ng) | Tomo (µL) |
≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Yuta/putik: 1-2g
● Intestinal content-hayop: 0.5-2g
● Intestinal sulod-insekto: 0.1-0.25g
● Ibabaw sa tanom (gipadako nga linugdang): 0.1-0.5g
● Fermentation sabaw enriched sediment): 0.1-0.5g
● Mga hugaw (dagko nga mga mananap): 0.5-2g
● Mga hugaw (ilaga): 3-5 ka lugas
● Pulmonary alveolar lavage fluid: filter nga papel
● Vaginal swab: 5-6 swab
● Panit/genital swab/laway/oral soft tissue/pharyngeal swab/rectal swab: 2-3 swab
● Mga microorganism sa nawong: filter nga papel
● Waterbody/hangin/biofilm: filter nga papel
● Endophytes: 1-2g
● Dental Plaque: 0.5-1g
Naglakip sa mosunod nga pagtuki:
Histogram sa taxonomic distribution
taxonomic abundance clustering heat map
Pag-analisar sa pagkalainlain sa Alpha: rarefaction curve
beta diversity analysis: NMDS
Pagtuki sa intergroup: LEFSE biomarker nga pagkadiskobre
Susihon ang mga pag-uswag nga gipadali sa mga serbisyo sa pagsunud sa amplicon sa BMKGene kauban ang Illumina pinaagi sa usa ka curated nga koleksyon sa mga publikasyon.
Dong, C. ug uban pa. (2022) 'Assembly, Core Microbiota, ug Function sa Rhizosphere Soil ug Bark Microbiota sa Eucommia ulmoides', Frontiers sa Microbiology, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
Li, Y. ug uban pa. (2023) 'Synthetic bacterial consortia transplantation alang sa pagtambal sa Gardnerella vaginalis-induced bacterial vaginosis sa mga ilaga', Microbiome, 11(1), pp. 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. ug Liu, H. (2022) 'Microbiomes sa abug sa hangin nga nakolekta sa panahon sa ground-based closed bioregenerative life support eksperimento "Lunar Palace 365"', Environmental Microbiomes, 17(1), pp. 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
Yin, S. ug uban pa. (2022) 'Daghang nagsalig sa feedstock sa mga gene nga magamit nga may kalabotan sa pagbag-o sa nitroheno nga kontrolado nga pagkawala sa nitrogen sa pag-compost', Bioresource Technology, 361, p. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.