Petita seqüenciació d'ARN-illumina
Funcions
● La preparació de la biblioteca inclou un pas de selecció de mida
● L'anàlisi bioinformàtica es va centrar en la predicció del miRNA i els seus objectius
Avantatges del servei
●Anàlisi bioinformàtica integral:Permetent la identificació de miRNAs coneguts i nous, la identificació de objectius dels miRNAs i l’anotació i l’enriquiment funcionals corresponents amb diverses bases de dades (KEGG, GO)
●Control de qualitat rigorós: Implementa punts de control bàsics a totes les etapes, des de la preparació de mostres i biblioteques fins a la seqüenciació i la bioinformàtica. Aquest seguiment minuciós garanteix el lliurament de resultats constantment de gran qualitat.
●Suport post-vendes: El nostre compromís s’estén més enllà de la finalització del projecte amb un període de servei posterior a tres mesos. Durant aquest temps, oferim un seguiment del projecte, assistència de resolució de problemes i sessions de Q&A per abordar qualsevol consulta relacionada amb els resultats.
●Àmplia experiència: Amb un historial de tancament amb èxit sobre diversos projectes de SRNA que abasten més de 300 espècies en diversos dominis de recerca, el nostre equip aporta una gran experiència a tots els projectes.
Requisits de mostra i lliurament
| Biblioteca | Plataforma | Dades recomanades | Dades QC |
| Mida seleccionada | Il·lumina se50 | Llegits de 10m-20m | Q30≥85% |
Requisits de mostra:
Nucleòtids:
| Conc. (NG/μL) | Quantitat (μg) | Puresa | Integritat |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Contaminació limitada o nul·la de proteïnes o ADN que es mostra al gel. | RIN≥6,0; 5.0≥28s/18S≥1.0; elevació de base limitada o sense base |
● Plantes:
Arrel, tija o pètal: 450 mg
Fulla o llavor: 300 mg
Fruita: 1,2 g
● Animal:
Cor o intestí: 450 mg
Vísceres o cervells: 240 mg
Múscul: 600 mg
Ossos, cabells o pell: 1,5 g
● Artròpodes:
Insectes: 9G
Crustacea: 450 mg
● Sang sencera: 2 tubs
● Cel·les: 106 cèl·lules
● Sèrum i plasma:6 ml
Lliurament de mostres recomanat
Contenidor: Tub de centrífuga de 2 ml (no es recomana la làmina de llauna)
Etiquetatge de mostres: grup+replica per exemple A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Enviament:
1. Gole sec: cal que les mostres siguin envasades en bosses i enterrades en gel sec.
2. Tubs rnastables: les mostres d’ARN es poden assecar en tub d’estabilització d’ARN (per exemple, RNastable®) i enviades a temperatura ambient.
Flux de treball del servei
Disseny d'experiments
Lliurament de mostra
Extracció d’ARN
Construcció de la biblioteca
Seqüenciació
Anàlisi de dades
Serveis postvenda
Bioinformàtica
● Control de qualitat de les dades en brut
● Classificació SRNA
● Alineació a un genoma de referència
● Identificació de miRNA conegut i nou
● Anàlisi de l'expressió de miRNA diferencial
● Anotació funcional dels objectius de miRNA
Identificació del miRNA: estructura i profunditat
Expressió diferencial de miRNA - clustering hearchical
Anotació funcional de l'objectiu de miRNAs expressats de manera diferent
Exploreu els avenços de la investigació facilitats pels serveis de seqüenciació de SRNA de BMKGENE mitjançant una col·lecció de publicacions curat.
Chen, H. et al. (2023) "Les infeccions virals inhibeixen la biosíntesi de saponina i la fotosíntesi a Panax Notoginseng", Fisiologia vegetal i bioquímica, 203, pàg. 108038. Doi: 10.1016/j.phaphy.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) "La proteïna que conté el domini FYVE de la planta Free1 associa amb components de microprocessador per reprimir la biogènesi miRNA", EMBO Reports, 24 (1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/supl_file/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) "El microRNA AME-BANTAM-3P controla el desenvolupament pupal larvari dirigint-se als múltiples dominis de creixement epidèrmic 8 Gene (MEGF8) a l'abella de mel, Apis mellifera ', International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), P . 5726. Doi: 10.3390/ijms24065726/s1.
Zhang, M. et al. (2018) 'L'anàlisi integrada del miRNA i els gens associats a la qualitat de la carn revela que el GGA-miR-140-5p afecta la deposició de greixos intramusculars en els pollastres', fisiologia cel·lular i bioquímica, 46 (6), pp. 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.
