RNA petit

Els ARNs petits són ARN no codificants curts amb una longitud mitjana de 18-30 NT, inclosos miRNA, siRNA i pirna, que tenen un paper important en els processos reguladors. El gasoducte SRNA BMKCLOUD proporciona una anàlisi estàndard i personalitzada per a la identificació de miRNA. Després de retallar la retallada i control de qualitat, les lectures s’alineen amb diverses bases de dades per classificar els SRNm i seleccionar miRNAs i mapejar -se al genoma de referència. Els miRNAs s’identifiquen a partir de bases de dades de miRNA conegudes, proporcionant informació sobre l’estructura secundària, la família de miRNA i els gens objectiu. L’anàlisi d’expressió diferencial identifica els miRNAs expressats de manera diferent i els gens objectiu corresponents s’anoten funcionalment per trobar categories enriquides.