Destacats
En aquest webinar de dues hores, és el nostre gran honor haver convidat a sis experts en Crop Genomics Arena. Els nostres ponents donaran una interpretació en profunditat sobre dos estudis genòmics de sègol, que recentment es van publicar recentmentGenètica de la natura:
1. El muntatge del genoma a escala de cromosomes proporciona informació sobre la biologia de sègol, l'evolució i el potencial agronòmic
2. Un conjunt del genoma d'alta qualitat destaca les característiques genòmiques del sègol i els gens agronòmicament importants
A més, ens complau tenir un científic sènior de R + D de Biomarker Technologies per compartir la seva experiència a l’assemblea de genoma de nou.
Agenda
09:00 AM CET
Observacions de benvinguda
Zheng Hong-kun
Fundador i conseller delegat Biomarker Technologies
Deng Xing-Wang
President de l'Escola de Ciències Agrícoles Avançades Peking University
09:15 AM
Millora de la millora de sègol, triticale i blat mitjançant l'ús de la seqüència de genoma de referència d'alta qualitat
En aquest seminari web, el professor Wang ens va oferir actualitzacions generals sobre l'estat actual de la investigació genòmica de Triticeae i va demostrar l'èxit i els desglossaments dels dos treballs destacats en estudis del genoma de Rye, que recentment es van publicar sobre Nature Genetics i introduir tota la investigació Grups liderant i contribuint a les obres.
09:25 AM
Cereal Genomics @ IPK Gatersleben
Les herbes cereals de la tribu Triticeae han estat una font important alimentària a les regions temperades, que fa temps que es considera un punt de mira en la millora i la cria dels cultius. Entre totes les espècies conreades, aquesta tribu és famosa per les seves característiques genòmiques extremadament complexes, com ara grans mides del genoma, alt contingut de TE, poliploidia, etc. En aquesta sessió, el professor Nils Stein ens va donar una introducció global a IPK Gatersleben i l'estat actual del cereal Genomic Research@IPK Gatersleben.
09:35 AM
El muntatge del genoma a escala de cromosomes proporciona informació sobre la biologia de sègol, l'evolució i el potencial agronòmic
M Timothy Rabanus-Wallace, Institut Leibniz of Plant Genetics and Crop Plan Research (IPK)El Rye (Secale Cereale L.) és un cultiu de cereals excepcionalment resistent al clima, utilitzat àmpliament per produir varietats de blat millorades mitjançant una hibridació introgressiva i que posseeix tot el repertori de gens necessaris per permetre la cria híbrida. El sègol és al·logam i només recentment domesticat, cosa que dóna accés a les ryes conreades a una piscina de gens salvatge divers i explotable. Per millorar encara més el potencial agronòmic de Rye, vam produir un conjunt anotat a escala de cromosomes del genoma de Rye de 7,9 Mbp i vam validar àmpliament la seva qualitat mitjançant un conjunt de recursos genètics moleculars. Demostrem aplicacions d’aquest recurs amb una àmplia gamma d’investigacions. Presentem troballes sobre l’aïllament genètic incomplet de Rye cultivat de familiars salvatges, mecanismes d’evolució estructural del genoma, resistència al patògens, tolerància a la temperatura baixa, sistemes de control de la fertilitat per a la cria híbrida i el rendiment beneficia de les introgressions del blat de sègol.
10:05 AM
Un muntatge del genoma d'alta qualitat destaca les característiques genòmiques del sègol i els gens agronòmicament importants
El Rye és un valuós cultiu d’aliments i farratges, un important recurs genètic per a la millora del blat i la triticale i un material indispensable per a estudis de genòmica comparativa eficients en herbes. Aquí, vam seqüenciar el genoma de Weining Rye, una varietat de sègol xinès d’elit. Els contigus muntats (7,74 GB) representaven el 98,47% de la mida estimada del genoma (7,86 GB), amb el 93,67% dels contigus (7,25 GB) assignats a set cromosomes. Elements repetitius constituïen el 90,31% del genoma muntat. En comparació amb els genomes de Triticeae seqüenciats anteriorment, Daniela, Sumaya i Sumana retrotransposons van mostrar una forta expansió en el sègol. Les anàlisis posteriors de Weining Assembly van fer una nova llum sobre les duplicacions de gens a tot el genoma i el seu impacte en els gens de la biosíntesi de midó, les organitzacions físiques de loci complexos de prolamines, l'expressió gènica presenta un tret de rereprès primerenc i les regions cromosòmiques associades a la domesticació putativa i els loci en Rye. Aquesta seqüència del genoma promet accelerar la genòmica i els estudis de cria de sègol i cultius de cereals relacionats.
10:35 AM
Reptes, solucions i futur per a l’assemblea del genoma de nou
El genoma d’alta qualitat és la base de l’estudi genòmic. Tot i que el ràpid desenvolupament en la seqüenciació i l'algoritme ha apoderat un conjunt de genomes molt més senzill i eficient, els requisits en la precisió i la integritat del muntatge també augmenten amb l'aprofundiment dels objectius de recerca. En aquesta xerrada parlaré de les tecnologies populars actuals de l’assemblea del genoma amb diversos casos d’èxit i faré una visió del futur desenvolupament.
Posada Posada: 08 de gener de 2012