Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Productes

Seqüenciació de l'exoma sencera humana

La seqüenciació d'exomes senceres humanes (HWES) és àmpliament reconeguda com un enfocament de seqüenciació rendible i potent per assenyalar mutacions que causen malalties. Tot i constituir només un 1,7% de tot el genoma, els exons tenen un paper crucial reflectint directament el perfil de les funcions proteïnes totals. Sobretot, en el genoma humà, més del 85% de les mutacions relacionades amb malalties es manifesten dins de les regions de codificació de proteïnes. BMKGENE ofereix un servei de seqüenciació integral i flexible de les exomes humanes amb dues estratègies de captació exons diferents disponibles per assolir diversos objectius de recerca.


Detalls del servei

Resultats de la demostració

Característiques del servei

● Dos panells exomes disponibles en funció de l'enriquiment de l'objectiu amb les sondes: Segur que seleccioneu Human All Exon V6 (Agilent) i XGen Exome Hybridization Panel V2 (IDT).

● Seqüenciació a Illumina Novaseq.

● Pipeline bioinformàtic dirigit a l’anàlisi de malalties o a l’anàlisi del tumor.

Avantatges del servei

Té com a objectiu la regió de codificació de proteïnes: En capturar i seqüenciar les regions de codificació de proteïnes, HWES s'utilitza per revelar variants relacionades amb l'estructura de proteïnes.

Rendible:HWES produeix aproximadament el 85% de les mutacions associades a la malaltia humana de l’1% del genoma humà.

Alta precisió: Amb una alta profunditat de seqüenciació, HWES facilita la detecció de variants comunes i variants rares amb freqüències inferiors a l’1%.

Control de qualitat rigorós: Implemen cinc punts de control bàsics en totes les etapes, des de la preparació de mostres i biblioteques fins a la seqüenciació i la bioinformàtica. Aquest seguiment minuciós garanteix el lliurament de resultats constantment de gran qualitat.

Anàlisi bioinformàtica completa: El nostre pipeline va més enllà de la identificació de variacions al genoma de referència, ja que incorpora anàlisis avançades dissenyades per abordar específicament qüestions de recerca relacionades amb aspectes genètics de malalties o anàlisi del tumor.

Suport post-vendes:El nostre compromís s’estén més enllà de la finalització del projecte amb un període de servei posterior a tres mesos. Durant aquest temps, oferim un seguiment del projecte, assistència de resolució de problemes i sessions de Q&A per abordar qualsevol consulta relacionada amb els resultats.

Especificacions de la mostra

Estratègia de captura exon

Estratègia de seqüenciació

Sortida de dades recomanada

Segur que seleccioneu Human All Exon V6 (Agilent)

o Xgen Exoma Panel V2 (IDT)

 

Illumina novaseq PE150

5 -10 GB

Per a trastorns mendelians/malalties rares:> 50x

Per a mostres de tumors: ≥ 100x

Requisits de la mostra

Tipus de mostra

 

 Quantitat(Qubit®)

 

Concentració 

Volum

 

 

 Puresa (nanodrop ™)

 

ADN genòmic

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 µl
 
OD260/280 = 1,8-2.0
 
Sense degradació, sense contaminació

 

Bioinformàtica

Wes_bi work flow_disease-01

L’anàlisi bioinformàtica de mostres de malaltia HWES inclou:

● Seqüenciació de dades QC

● Alineació del genoma de referència

● Identificació de SNP i indels

● Anotació funcional de SNP i indels

Wes_bi work flow_tumor-01

L’anàlisi bioinformàtica de mostres de tumors inclou:

● Seqüenciació de dades QC

● Alineació del genoma de referència

● Identificació de SNP, indels i variacions somàtiques

● Identificació de variants de línia germinal

● Anàlisi de signatures de mutació

● Identificació de gens d'accionament basats en mutacions de guany de funció

● Anotació de mutació a nivell de susceptibilitat al fàrmac

● Anàlisi d’heterogeneïtat: càlcul de puresa i ploidy

Flux de treball del servei

Lliurament de mostra

Lliurament de mostra

Experiment pilot

Extracció d'ADN

Preparació de la biblioteca

Construcció de la biblioteca

Seqüenciació

Seqüenciació

Anàlisi de dades

Anàlisi de dades

数据上传 -01

Lliurament de dades

SERVEIS DE SEGUI

Serveis postvenda


  • Anterior:
  • A continuació:

  • Dades QC: estadístiques de captura de l'exoma

     

    wps_doc_22

     

    Identificació de variants: indels

    图片 36

    Anàlisi avançada: identificació i distribució de SNPs/indels perjudicials - trama Circos

     

    图片 37

    Anàlisi del tumor: Identificació i distribució de mutacions somàtiques: trama de circos

     

    图片 38

     

    Anàlisi del tumor: llinatges clonals

     

    图片 39

     

    Obteniu un pressupost

    Escriviu el vostre missatge aquí i ens ho envieu

    Envieu -nos el vostre missatge: