●Plataforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Modes de seqüenciació:PE150
●Transferència de biblioteques Illumina aMGI:permetent la seqüenciació de grans volums de dades a baix cost.
●Control de qualitat de les biblioteques abans de la seqüenciació.
●Seqüenciació de dades de control de qualitat i lliurament:lliurament d'informes de control de qualitat i dades en brut en format fastq després de demultiplexar i filtrar les lectures Q30.
●Versatilitat dels serveis de seqüenciació:el client pot optar per seqüenciar per carril o quantitat de dades.
●Alta sortida de dades:1500 Gb/carril
●Lliurament de l'informe de control de qualitat de seqüenciació:amb mètriques de qualitat, precisió de les dades i rendiment global del projecte de seqüenciació.
●Procés de seqüenciació madur:amb un temps de retorn curt.
●Control de qualitat rigorós: implementem requisits estrictes de control de qualitat per garantir el lliurament de resultats d'alta qualitat constant.
Import de dades (X) | Concentració (qPCR/nM) | Volum | |
Carril parcial
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
Carril únic | Per Lane | ≥ 1,5 nM / pool de biblioteca | ≥ 25 μl / piscina biblioteca |
A més de la concentració i la quantitat total, també es requereix un patró de pics adequat.
Nota: La seqüenciació de carrils de biblioteques de baixa diversitat requereix l'entrada de PhiX per garantir una trucada base robusta.
Recomanem enviar biblioteques prèviament agrupades com a mostres. Si necessiteu que BMKGENE realitzi l'agrupació de biblioteques, consulteu el
requisits de la biblioteca per a la seqüenciació parcial del carril.
El pic principal hauria d'estar entre 300 i 450 pb.
Les biblioteques haurien de tenir un únic pic principal, sense contaminació de l'adaptador i sense dímers d'imprimació.
Es proporciona un informe sobre la qualitat de la biblioteca abans de la seqüenciació, l'avaluació de la quantitat de la biblioteca i la fragmentació.
Taula 1. Estadístiques de dades de seqüenciació.
Identificació de la mostra | BMKID | Lectures crues | Dades en brut (pb) | Lectures netes (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribució de la qualitat al llarg de les lectures de cada mostra
Figura 2. Distribució del contingut base
Figura 3. Distribució dels continguts llegits en dades de seqüenciació