Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Productes

Biblioteques prefabricades DNBSEQ

DNBSEQ, desenvolupat per MGI, és una tecnologia NGS innovadora que ha aconseguit reduir encara més els costos de seqüenciació i augmentar el rendiment. La preparació de les biblioteques DNBSEQ implica la fragmentació de l'ADN, la preparació de ssDNA i l'amplificació del cercle rodant per obtenir les nanoboles d'ADN (DNB). A continuació, es carreguen sobre una superfície sòlida i posteriorment es seqüencian mitjançant la síntesi combinatòria de sonda-àncora (cPAS). La tecnologia DNBSEQ combina els avantatges de tenir una taxa d'error d'amplificació baixa amb l'ús de patrons d'error d'alta densitat amb nanoboles, donant com a resultat una seqüenciació amb un rendiment i una precisió més elevats.

El nostre servei de seqüenciació de biblioteques prefabricats permet als clients preparar biblioteques de seqüenciació Illumina a partir de fonts diverses (ARNm, genoma sencer, amplicó, biblioteques 10x, entre d'altres), que es converteixen en biblioteques MGI als nostres laboratoris per ser seqüenciades en DNBSEQ-T7, cosa que permet grans quantitats de dades a menors costos.


Detalls del servei

Resultat de demostració

Característiques

Plataforma:MGI-DNBSEQ-T7

Modes de seqüenciació:PE150

Transferència de biblioteques Illumina aMGI:permetent la seqüenciació de grans volums de dades a baix cost.

Control de qualitat de les biblioteques abans de la seqüenciació.

Seqüenciació de dades de control de qualitat i lliurament:lliurament d'informes de control de qualitat i dades en brut en format fastq després de demultiplexar i filtrar les lectures Q30.

 

Avantatges

Versatilitat dels serveis de seqüenciació:el client pot optar per seqüenciar per carril o quantitat de dades.

Alta sortida de dades:1500 Gb/carril

Lliurament de l'informe de control de qualitat de seqüenciació:amb mètriques de qualitat, precisió de les dades i rendiment global del projecte de seqüenciació.

Procés de seqüenciació madur:amb un temps de retorn curt.

Control de qualitat rigorós: implementem requisits estrictes de control de qualitat per garantir el lliurament de resultats d'alta qualitat constant.

 

Exemples de requisits

 

Import de dades (X)

Concentració (qPCR/nM)

Volum

Carril parcial

   

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 μl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 Gb < X ≤ 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 Gb

≥ 4 nM

 

Carril únic

Per Lane

≥ 1,5 nM / pool de biblioteca

≥ 25 μl / piscina biblioteca

A més de la concentració i la quantitat total, també es requereix un patró de pics adequat.

Nota: La seqüenciació de carrils de biblioteques de baixa diversitat requereix l'entrada de PhiX per garantir una trucada base robusta.

Recomanem enviar biblioteques prèviament agrupades com a mostres. Si necessiteu que BMKGENE realitzi l'agrupació de biblioteques, consulteu el

requisits de la biblioteca per a la seqüenciació parcial del carril.

Mida de la biblioteca (mapa màxim)

El pic principal hauria d'estar entre 300 i 450 pb.

Les biblioteques haurien de tenir un únic pic principal, sense contaminació de l'adaptador i sense dímers d'imprimació.

Flux de treball del servei

preparació de mostres-
Seqüenciació
Anàlisi de dades
Mostra-QC

  • Anterior:
  • Següent:

  • Informe de control de qualitat de la biblioteca

    Es proporciona un informe sobre la qualitat de la biblioteca abans de la seqüenciació, l'avaluació de la quantitat de la biblioteca i la fragmentació.

     

    Informe de control de qualitat de seqüenciació

     

    Taula 1. Estadístiques de dades de seqüenciació.

    Identificació de la mostra

    BMKID

    Lectures crues

    Dades en brut (pb)

    Lectures netes (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96,48

    99.14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96.00

    98,95

    93,89

    37.08

    Figura 1. Distribució de la qualitat al llarg de les lectures de cada mostra

    A9

    Figura 2. Distribució del contingut base

    A10

    Figura 3. Distribució dels continguts llegits en dades de seqüenciació

    A11

    obtenir un pressupost

    Escriu el teu missatge aquí i envia'ns-ho

    Envia'ns el teu missatge: