Illumina Biblioteques pre-elaborades
Funcions
●Plataformes:Illumina Novaseq 6000 i Novaseq X Plus
●Modes de seqüenciació:PE150 i PE250
●Control de qualitat de les biblioteques abans de la seqüenciació
●Seqüenciació de dades QC i lliurament:Lliurament d’informe QC i dades en brut en format FASTQ després de la demultiplexació i el filtratge Q30
Avantatges del servei
●Versatilitat dels serveis de seqüenciació:El client pot optar per seqüenciar per carril, cel·la de flux o per quantitat de dades necessàries (seqüenciació parcial del carril).
●Experiència àmplia a la plataforma de seqüenciació Illumina:amb milers de projectes tancats amb diverses espècies.
●Enviament de la seqüenciació Informe QC:Amb mètriques de qualitat, precisió de dades i rendiment global del projecte de seqüenciació.
●Procés de seqüenciació madura:amb un temps de torn curt.
●Control de qualitat rigorós: Implemen requisits de QC estrictes per garantir el lliurament de resultats de qualitat constant.
Plataformes de mostra
| Plataforma | Cel·la | Mode de seqüenciació | Unitat | Sortida estimada |
| Novaseq x | 10b (8 carrils) | PE150 | Carril únic Carril parcial | 375 GB / carril |
| 25b (8 carrils) | PE150 | Carril únic Carril parcial | 1000 GB/carril | |
| Novaseq 6000 | Cèl·lula de flux SP (2 carrils) | PE250 | Cel·la Carril únic Carril parcial | 325-400 m de lectura / carril |
| Cèl·lula de flux S4 (4 carrils) | PE150 | Cel·la Carril únic Carril parcial | ~ 800 GB / carril |
Requisits de la mostra
| Import de dades (x) | Concentració (qPCR/NM) | Volum | |
| Seqüenciació parcial del carril
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 µl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 µl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 µl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 µl | |
| Seqüenciació de carril | Per carril | ≥ 1,5 nm / conjunt de biblioteques | ≥ 25 µl / conjunt de biblioteques |
A més de la concentració i la quantitat total, també cal un patró de pic adequat.
Nota: la seqüenciació de carrils de biblioteques de baixa diversitat requereix un pic de Phix per assegurar una crida de base robusta.
Recomanem enviar les biblioteques pre-piscines com a mostres. Si necessiteu BMKGENE per realitzar l'agrupació de biblioteques, consulteu
Els requisits de la biblioteca per a la seqüenciació parcial del carril.
Mida de la biblioteca (mapa màxim)
El pic principal hauria d’estar dins dels 300-450 pb.
Les biblioteques haurien de tenir un únic pic principal, sense contaminació per adaptadors i sense dímers d’imprimació.
Si us plau, poseu -vos en contacte amb nosaltres si les vostres mostres no compleixen els requisits de material inicial.
Flux de treball del servei
Control de qualitat de la biblioteca
Seqüenciació
Control de qualitat de les dades
Lliurament del projecte
Informe QC de la biblioteca
Es proporciona un informe sobre la qualitat de la biblioteca abans de la seqüenciació, avaluant la quantitat de la biblioteca i la fragmentació.
Seqüenciació Informe QC
Taula 1. Estadístiques sobre dades de seqüenciació.
| Identificador de mostra | Bmkid | Raw llegeix | Dades en brut (BP) | Lectures netes (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
Figura 1. Distribució de qualitat al llarg de lectures a cada mostra
Figura 2. Distribució de contingut de la base
Figura 3. Distribució dels continguts de lectura a les dades de seqüenciació
