Circrna

Els ARN circulars (CIRCRNAs) són ARN no codificants que formen estructures circulars i tenen múltiples rols reguladors, incloent competir amb miRNA per a gens diana i unió de proteïnes. El gasoducte BMKCLOUD CIRCRNA està dissenyat per a l’anàlisi de les biblioteques esgotades d’RNA amb un genoma de referència ben anotat i d’alta qualitat. L’anàlisi comença amb la retallada de lectura i el control de qualitat, seguida de l’alineació de lectura al genoma de referència i la predicció de nous cirrnas, juntament amb la identificació de cirrnas coneguts a partir de bases de dades. Posteriorment s’identifiquen els objectius de miRNA corresponents i els amfitrions de CIRCRNA. L’anàlisi de l’expressió diferencial revela circrnas expressats de manera diferent i els hostes corresponents s’anoten funcionalment per extreure funcions biològiques enriquides.