Setovi alata

BMKCloud je vodeća bioinformatička platforma koja pruža jedno-stop rješenje za genomske programe, kojemu široko vjeruju istraživači u različitim oblastima uključujući medicinu, poljoprivredu, okoliš, itd. BMKCloud je posvećen pružanju integriranih, pouzdanih i efikasnih usluga uključujući platforme i alate za bioinformatičku analizu , računarski resursi, javna baza podataka, bioinformtički onlajn kursevi, itd. BMKCloud ima različite često korišćene bioinformatičke alate uključujući i beleške gena, evolucijski genetski alati, ncRNA, kontrola kvaliteta podataka, sklapanje, poravnanje, ekstrakcija podataka, mutacije, statistika, generator figura, analiza sekvence, itd.

Kontaktirajte nas

Detalji usluge

Ladica sa toplotnom mapom

Heatmap fioka se koristi za crtanje toplotne mape, koja može filtrirati, normalizovati i grupirati matrične podatke. Uglavnom se koristi za klaster analizu nivoa ekspresije gena između različitih uzoraka.

Gene Annotation

Priključivanje bioloških funkcija sekvencama u FASTA datoteci poravnavanjem sekvenci sa bazom podataka, uključujući NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.

BLAST

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) je algoritam i program za pronalaženje regiona sa sličnim biološkim sekvencama. On upoređuje ove sekvence sa bazama podataka sekvenci i izračunava statističku značajnost. BLAST se sastoji od četiri tipa alata zasnovanih na tipu sekvence: blastn, lastp, blastx i tblastn.