-
BMKMANU S3000_Prostorni transkript
Prostorna transkriptomika je na čelu naučne inovacije, osnažujući istraživače da uđu u zamršene obrasce ekspresije gena unutar tkiva, istovremeno čuvajući njihov prostorni kontekst. Usred različitih platformi, BMKGene je razvio BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, koji se može pohvaliti poboljšanom rezolucijom od 3,5 µm, dostižući subćelijski opseg i omogućavajući postavke rezolucije na više nivoa. Čip S3000, koji ima približno 4 miliona tačaka, koristi mikro-jažice obložene kuglicama napunjenim prostorno barkodiranim sondama za hvatanje. Biblioteka cDNK, obogaćena prostornim bar kodovima, pripremljena je od S3000 čipa i potom sekvencirana na platformi Illumina NovaSeq. Kombinacija prostorno barkodiranih uzoraka i UMI-ja osigurava tačnost i specifičnost generiranih podataka. BMKManu S3000 čip je izuzetno svestran, nudi postavke rezolucije na više nivoa koje se mogu fino podesiti prema različitim tkivima i željenim nivoima detalja. Ova prilagodljivost pozicionira čip kao izvanredan izbor za različite studije prostorne transkriptomije, osiguravajući precizno prostorno grupiranje uz minimalan šum. Upotreba tehnologije segmentacije ćelija sa BMKManu S3000 omogućava razgraničenje transkripcionih podataka do granica ćelija, što rezultira analizom koja ima direktno biološko značenje. Nadalje, poboljšana rezolucija S3000 rezultira većim brojem gena i UMI detektiranih po ćeliji, omogućavajući mnogo precizniju analizu prostornih obrazaca transkripcije i grupisanja ćelija.
-
DNBSEQ unapred napravljene biblioteke
DNBSEQ, koji je razvio MGI, je inovativna NGS tehnologija koja je uspjela dodatno smanjiti troškove sekvenciranja i povećati propusnost. Priprema DNBSEQ biblioteka uključuje fragmentaciju DNK, pripremu ssDNK i amplifikaciju kružnog toka kako bi se dobile DNK nanokuglice (DNB). Oni se zatim stavljaju na čvrstu površinu i potom sekvenciraju kombinatornom sintezom sonde i sidra (cPAS). DNBSEQ tehnologija kombinuje prednosti niske stope greške u pojačavanju sa korišćenjem uzoraka greške velike gustine sa nanokuglicama, što rezultira sekvenciranjem sa većom propusnošću i preciznošću.
Naša gotova usluga sekvenciranja biblioteka omogućava korisnicima da pripreme Illumina biblioteke sekvenciranja iz različitih izvora (mRNA, cijeli genom, amplicon, 10x biblioteke, između ostalih), koje se u našim laboratorijama pretvaraju u MGI biblioteke kako bi se sekvencionirale u DNBSEQ-T7, što omogućava velike količine podataka uz niže troškove.
-
Interakcija hromatina na bazi Hi-C
Hi-C je metoda dizajnirana za hvatanje genomske konfiguracije kombinacijom sondiranja interakcija zasnovanih na blizini i sekvenciranja visoke propusnosti. Metoda se zasniva na umrežavanju hromatina sa formaldehidom, praćenom digestijom i ponovnom ligacijom na način da samo fragmenti koji su kovalentno povezani formiraju produkte ligacije. Sekvenciranjem ovih proizvoda ligacije moguće je proučavati 3D organizaciju genoma. Hi-C omogućava proučavanje distribucije delova genoma koji su slabo zbijeni (A odjeljci, euhromatin) i vjerojatnije da će biti transkripcijski aktivni, te regija koje su čvršće upakovane (B odjeljci, Heterohromatin). Hi-C se takođe može koristiti za preciziranje topološki povezanih domena (TAD), regiona genoma koji imaju presavijene strukture i verovatno će imati slične obrasce ekspresije, kao i za identifikaciju hromatinskih petlji, regiona DNK koji su zajedno usidreni proteinima i koji su često obogaćena regulatornim elementima. BMKGene-ova Hi-C usluga sekvenciranja osnažuje istraživače da istraže prostorne dimenzije genomike, otvarajući nove puteve za razumijevanje regulacije genoma i njenih implikacija na zdravlje i bolesti.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
Pročistite visokokvalitetnu ukupnu RNK iz biljnih tkiva
-
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA komplet
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA komplet
Napunjeni komplet reagensa za uložak/ploču za pročišćavanje ukupne RNK visokog prinosa, visoke čistoće, visoke kvalitete, bez inhibitora iz životinjskog tkiva/ćelije/svježe pune krvi
-
TGuide Smart Magnetic Plant DNK Kit
TGuide Smart Magnetic Plant DNK Kit
Pročistite visokokvalitetni genomski DNK iz različitih biljnih tkiva
-
TGuide Smart Soil / Stool DNK komplet
TGuide Smart Soil / Stool DNK komplet
Pročišćava DNK bez inhibitora visoke čistoće i kvaliteta iz uzoraka tla i stolice
-
TGuide Smart DNK Purification Kit
Oporavlja visokokvalitetni DNK iz PCR proizvoda ili gelova agaroze.
-
TGuide Smart Blood Genomic DNK komplet
TGuide Smart Blood Genomic DNK komplet
Napunjeni komplet reagensa za uložak/ploču za pročišćavanje genomske DNK iz krvi i pudera
-
TGuide Smart Magnetic Tissue DNK komplet
Komplet napunjenih kertridža/ploča reagensa za ekstrakciju genomske DNK iz životinjskog tkiva
-
TGuide Smart univerzalni DNK komplet
Komplet napunjenih kertridža/ploča reagensa za pročišćavanje genomske DNK iz krvi, osušene mrlje krvi, bakterija, ćelija, pljuvačke, oralnih briseva, životinjskog tkiva itd.
-
TGuide S16 Ekstraktor nukleinske kiseline
TGuide S16 Ekstraktor nukleinske kiseline
Stolni instrument jednostavan za korištenje, 1-8 ili 16 uzoraka u isto vrijeme
Kataloški broj / pakiranje
Cat. br
ID
Broj priprema
OSE-S16-AM
1 set
-
PacBio 2+3 mRNA rješenje pune dužine
Dok je sekvenciranje mRNA zasnovano na NGS-u svestran alat za kvantifikaciju ekspresije gena, njegovo oslanjanje na kratko čitanje ograničava njegovu efikasnost u složenim transkriptomskim analizama. S druge strane, PacBio sekvenciranje (Iso-Seq) koristi tehnologiju dugog čitanja, omogućavajući sekvenciranje mRNA transkripata pune dužine. Ovaj pristup olakšava sveobuhvatno istraživanje alternativnog spajanja, fuzije gena i poliadenilacije, iako nije primarni izbor za kvantifikaciju ekspresije gena. Kombinacija 2+3 premošćuje jaz između Illumina i PacBio oslanjajući se na PacBio HiFi čitanja za identifikaciju kompletnog skupa izoforma transkripta i NGS sekvenciranja za kvantifikaciju identičnih izoforma.
Platforme: PacBio Sequel II/ PacBio Revio i Illumina NovaSeq;
