BMKCloud Prijavite se

Snažni alati za analizu

wps_doc_13

Grijač

Alat za toplotnu mapu prihvaća matričnu datoteku podataka kao ulaz i omogućava korisnicima da filtriraju, normalizuju i klasterski podaci. Slučaj primarne upotrebe za toplotne mape je klaster analiza nivoa izraza gena između različitih uzoraka.

 

wps_doc_14

Napomena gena

Alat za napomenu Gena vrši se gene na osnovu usklađivanja sekvence ulazne faste datoteke protiv različitih baza podataka.

wps_doc_15

Osnovni alat za pretraživanje lokalnog poravnanja (eksplozija)

Alat eksplozije je BMKCloud Integrirana verzija NCBI eksplozije i može se koristiti za izvedbu iste funkcije pomoću podataka koji su postavljeni na BMKCloud račun.

wps_doc_16

CDS_UTR predviđanje

Alat za predviđanje CDS_UTR dizajniran je za predviđanje regiona kodiranja (CD-ovi) i ne-kodirajuće regije (UTR) u s obzirom na transkriptske sekvence temeljene na rezultatima eksplozije protiv poznatih proteinskih ishoda za predviđanje.

wps_doc_17

Menhattan zaplet

Alat za crtanje Manhattan omogućava prikaz eksperimenata visokog uzorka i obično se koristi u genomičnim studijama udruženja (GWAS).

wps_doc_18

Circos dijagram

Alat Dijagram Circos omogućava efikasnu vizualizaciju kako se genomička značajka distribuiraju po genom. Uobičajene karakteristike uključuju kvantitativni loci, spl, nevaže, indelovi, strukturne i kopiranje varijante.

wps_doc_19

Gene ontologiju (Go) obogaćivanje

Alat za obogaćivanje GO pruža funkcionalnu analizu obogaćivanja. Primarni softver u ovom alatu je paket topgo-biokonduktora koji uključuje analizu diferencijalnog izraza, idi analizu obogaćivanja i vizualizaciju rezultata.

wps_doc_20

Ponderirana analiza mrežnog izraza gena (WGCNA)

WGCNA je široko korištena metoda rudarstva podataka za otkrivanje modula genskih izraza izraza. Primjenjivo je na razni skup podataka o izražavanju, uključujući podatke o microarray-u i NGS eizmiju gena.

wps_doc_17

Interproscan

 Interproscan alat pruža interpretivno analizu i klasifikaciju sekvence proteina.

 

wps_doc_21

Idi Kegg obogaćivanje

Alat za obogaćivanje GO Kegg je dizajn za generiranje histograma obogaćivanja ivica, histogram za obogaćivanje kegg i staza obogaćivanja Kegg na osnovu pruženog gena i odgovarajućoj napomeni.

Nabavite citat

Ovdje napišite svoju poruku i pošaljite nam ga

Pošaljite nam svoju poruku: