Metagenomics (NGS)

Metagenomics sačmarice sa illumom popularan je alat za proučavanje mikrobioma izravno sekvenciranje DNK iz složenih uzoraka, omogućavajući istraživanje i taksonomske i funkcionalne raznolikosti. Cevovod BMKCloud Metagenomic (NGS) započinje kontrolom kvalitete i sklop Metagenome iz kojeg se gena predviđaju i klasterirani u ne-suvišne skupove podataka koji se nadare za funkciju i taksonomiju koristeći više baza podataka. Te se informacije koriste za analizu uzorkovanja uzorkoj smjernosti (alfa raznolikosti) i između raznolikosti između uzoraka (beta raznolikost). Diferencijalna analiza između grupa pronalazi Otus i biološke funkcije koje se razlikuju između dvije skupine koristeći oba parametrična i ne parametrična testova, dok korelacijska analiza odnosi ove razlike u faktore okoliša.