Studija udruženja u širokom genimetu (GWAS) ima za cilj identifikaciju genetskih varijanta (genotip) koji su povezane sa specifičnim osobinama (fenotip). GWA studije istražuju genetski markere prelaze cijeli genom velikog broja pojedinaca i predviđa genotipe-fenotipska udruženja statističkom analizom na nivou stanovništva. Sastavljanje cijelog gena potencijalno može otkriti sve genetske varijante. Spajanje sa fenotipskim podacima, GWAS se može obraditi za identifikaciju SNP-a povezanih sa fenotipom, qtls i kandidatnim genima, što snažno podržava modernu životinjsku / biljnu uzgoju. SLAF je samorazvijena pojednostavljena strategija sekvenciranja genoma, koja otkriva genome-širine markere, SNP. Ovi SNP, kao molekularni genetski markeri, mogu se obraditi za studije udruživanja ciljanim osobinama. To je ekonomična strategija u identificiranju složenih osobina povezanih genetskih varijacija.
