Analiza pridruživanja širokog genoma
Tijek rada
Prednosti usluge
●Opsežna evidencija stručnjaka i publikacije.
● Sveobuhvatna analiza bioinformatike: Tijek rada uključuje analizu pridruživanja SNP-osobina, pružajući skup kandidatskih gena i njihovu odgovarajuću funkcionalnu napomenu.
●Visoko kvalificirani bioinformatički tim i kratki ciklus analize: S velikim iskustvom u naprednoj analizi genomike, BMKGENI tim pruža sveobuhvatne analize s brzim vremenom pretvorenosti.
●Podrška za post-prodaja:Naša posvećenost se pruža izvan završetka projekta sa tromjesečnim periodom usluge nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekata, rešavanje problema i rješavanje problema i pitanja za rješavanje bilo kakvih upita u vezi s rezultatima.
Servisne specifikacije i zahtjevi
| Vrsta sekvenciranja | Preporučena skala populacije | Strategija sekvenciranja | Nukleotidni zahtjevi |
| Cijeli redoslijed genoma | 200 uzoraka | 10x | Koncentracija: ≥ 1 NG / μl Ukupna količina≥ 30NG Ograničena ili ne degradacija ili kontaminacija |
| Poseban lokus pojačani fragment (SLAF) | Dubina oznake: 10x Broj oznaka: <400 MB: Preporučuje se WGS <1gb: 100k oznake 1gb > 2GB: 300K oznake Max 500K oznake | Koncentracija ≥ 5 NG / μl Ukupni iznos ≥ 80 ng NanoDrop OD260 / 280 = 1,6-2,5 Agarozni gel: nema ili ograničene degradacije ili kontaminacija
|
Izbor materijala
Različite sorte, podvrste, landracije / genebanks / miješane porodice / divlji resursi
Različite sorte, podvrste, landraces
Površina Polu-sib / Full-Sib Porodična / divlji resursi
Servisni protok rada
Dizajn eksperimenta
Dostava uzoraka
Ekstrakcija RNA
Građevinarstvo biblioteke
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Uključuje sljedeću analizu:
- Analiza pridruživanja širokog genimenata: LM, LMM, EMMAX, FastLMM model
- Funkcionalna napomena gena kandidata
Analiza pridruživanja SNP-osobina - Menhattan zaplet
Analiza pridruživanja SNP-osobina - QQ plac
Istražite napredak koji se olakšaju BMKGENE-ove usluge DE GWAS kroz kustornu kolekciju publikacija:
LV, L. i dr. (2023) "uvid u genetsku osnovu tolerancije amonijaka u britvištu CLAM SINONOVAULA Constricta putem studije udruženja širokog genoma ',Akvakultura, 569, str. 739351. Doi: 10.1016 / J.Aquaculture.2023.739351.
Li, X. i dr. (2022) 'Multi-Omičke analize 398 Analiza milletnih alata otkriva genominske regije povezane sa pripitomska, metabolitnim osobinama i protuupalnim efektima ",Molekularna biljka, 15 (8), str. 1367-1383. Doi: 10.1016 / J.MOLP.2022.07.003.
Li, J. i dr. (2022) 'Mapiranje koljenja u velikoj mjeri za cijelo vrijeme, jedva fenotipova u okruženju suše',Granice u biljnoj nauci, 13, str. 924892. DOI: 10.3389 / FLLS.2022.924892 / bibtex.
Zhao, X. et al. (2021) 'GMST1, koji kodira sulfotransferazu, daje se otpornost na soja soja mozaičkog virusa G2 i G3',Postrojenje, ćelija i okruženje, 44 (8), str. 2777-2792. Doi: 10.1111 / pce.14066.
