
Analiza eukariotske MRNA (dostupne su referentne i de novo opcije)
Ovaj cjevovod koristi NGS RNA-SEQ podatke kao ulaz i proizvodi rezultate iz višestrukih nizvodnih analiza uključujući, ali ne ograničavajući se na: sekvenciranje kvalitete podataka,de novoNapomena za transkripciju, promjenjiva analiza spajanja, analiza diferencijalnog izraza, funkcija napomena i analiza obogaćivanja.
Duga ne-kodirna analiza RNA
Duga ne-kodiranje RNAS (LNCRNA) su ne-kodirani transkripti s duljinama dužim od 200 NT i poznati se da igraju uloge u kromatinskoj organizaciji i regulaciji. Tehnologije srednjeg protoka i bioinformatika osnažili su naše razumijevanje LNCRNA sekvenci i pozicioniranje podataka za identifikaciju LNCRNA-a s ključnim regulatornim funkcijama. Ovaj cjevovod pruža LNCRNA analizu pored analiza navedenih u cjevovodu za analizu eukariotske MRNA.


16S / 18S / Njegova amplikana sekvenciranja
Naftovod za analizu mikrobnog raznolikosti mikrobnog raznolikosti razvijena na osnovu godina iskustva u analizi projekta raznolikosti mikrobne raznolikosti. Cevovod sadrži standardizovanu osnovnu analizu, koja pokriva sadržaj glavne analize trenutne mikrobne istraživanja i personalizirane analize. Izvještaj o analizi je bogat i sveobuhvatan, uz mogućnost obavljanja raznolike lične analize. Uz to, uzorci i grupe mogu se mijenjati u letu za dodatnu prilagodbu i kontrolu.
Analiza metagenomike sačmarice
Metagenom analizom sačmarice koristi podatke o NGS-u iz miješanih genumskih materijala iznimljivih iz uzoraka okoliša. Uključene analize pružaju detaljne informacije o raznolikosti vrsta i obilju, strukturu stanovništva, filogenetskim odnosom, funkcionalnim genima i korelacijskim mrežama sa faktorima okoliša.


Analiza varijante NGS-WGS-a
Analiza varijante NGS-WGS-a je integrirani cjevovod za otkrivanje varijante koji vrši kontrolu kvalitete podataka, poravnavanje sekvence, napomena i analizu mutacije gena. Cevovod prati najbolje prakse GATK-a za detekcije SNP-a i Indela i koristi MANTA za konstrukcijske varijante.
Studija udruženja Genoma Wide (GWAS)
GWAS cjevovod je nizvodno analiza koja je prethodno generirala VCF datoteke i odgovarajuće podatke fenotipa za kohort pojedinaca kao ulaz. Koristeći specifične statističke metodologije, GWAS ima za cilj otkriti nukleotidne razlike u genomima povezanim sa fenotipskim razlikama. Igra ključnu ulogu u istraživanju funkcionalnih gena povezanih s složenim ljudskim bolestima i zamršenim osobinama u biljkama i životinjama.


Analiza skupne segregacije (BSA)
BSA analiza uključuje udruživanje pojedinaca sa ekstremnim fenotipskim osobinama iz segregantne populacije. Upoređujući diferencijalni LUCI između uzoraka sakupljanim uzorcima, ovaj pristup brzo identificira usko povezane molekularne markere povezane sa ciljanim genima. Široko se koristi u genetskom mapiranju biljaka i životinja, to je vrijedno sredstvo za uzgoj potpomognute marke.
Evolucijska analiza genetike
Evolucijska analiza genetike utječe na projekte BMKGENE-a u genetskim evolucijskim projektima i uključuje filogenetsku konstrukciju drveća, analiza nejednakog vezu, genetska procjena raznolikosti, selektivna identifikacija srodnikom, karakterizacija glavne komponente i karakterizaciju strukture stanovništva.
