Evoluciona genetika
Prednosti usluge
Takagi i dr.,Časopis za biljku, 2013
●Sveobuhvatna bioinformatička analiza:Omogućavanje procjene genetske raznolikosti, što odražava evolucijski potencijal vrste i otkriva pouzdanu filogenetska odnos između vrsta s minimiziranim utjecajem konvergentne evolucije i paralelne evolucije
●Neobavezna prilagođena analiza: poput procjene vremena i brzine divergencije zasnovane na varijacijama na nivou nukleotida i aminokiselina.
●Opsežna evidencija stručnjaka i publikacije.
● Visoko kvalificirani bioinformatički tim i kratki ciklus analize: S velikim iskustvom u naprednoj analizi genomike, BMKGENI tim pruža sveobuhvatne analize s brzim vremenom pretvorenosti.
● Podrška nakon prodaje:Naša posvećenost se pruža izvan završetka projekta sa tromjesečnim periodom usluge nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekata, rešavanje problema i rješavanje problema i pitanja za rješavanje bilo kakvih upita u vezi s rezultatima.
Servisne specifikacije i zahtjevi
| Vrsta sekvenciranja | Preporučena skala populacije | Strategija sekvenciranja | Nukleotidni zahtjevi |
| Cijeli redoslijed genoma | ≥ 30 pojedinaca, sa ≥ 10 pojedinaca iz svake podskupine
| 10x | Koncentracija: ≥ 1 NG / μl Ukupna količina≥ 30NG Ograničena ili ne degradacija ili kontaminacija |
| Poseban lokus pojačani fragment (SLAF) | Dubina oznake: 10x Broj oznaka: <400 MB: Preporučuje se WGS <1gb: 100k oznake 1gb > 2GB: 300K oznake Max 500K oznake | Koncentracija ≥ 5 NG / μl Ukupni iznos ≥ 80 ng NanoDrop OD260 / 280 = 1,6-2,5 Agarozni gel: nema ili ograničene degradacije ili kontaminacija
|
Servisni protok rada
Dizajn eksperimenta
Dostava uzoraka
Građevinarstvo biblioteke
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Usluga uključuje analizu strukture stanovništva (filogenetičko stablo, PCA, grafikon za stratifikaciju stanovništva), raznolikost stanovništva i odabir stanovništva (neravnomjer u povezivanju, selektivni izbor povoljnih web lokacija). Usluga također može uključivati prilagođenu analizu (npr. Vrijeme divergencije, genski protok).
*Ovdje prikazani demo rezultati su svi iz genoma objavljenih sa bmkgeneom
1.Vornica analiza sadrži izgradnju filogenetskog stabla, strukture stanovništva i PCA na osnovu genetskih varijacija.
Filogenetičko stablo predstavlja taksonomske i evolucijske odnose među vrstama sa zajedničkim predak.
PCA ima za cilj da vizualizira bliskost između podponoja.
Struktura stanovništva pokazuje prisustvo genetski izrazitog pod-stanovništva u pogledu frekvencija alela.
Chen, et. al.,PNAS, 2020
2. Objavljivanje
Selektivna pomicanja odnosi se na proces po kojem se odabere povoljna stranica i povećane su frekvencije povezanih neutralnih mesta, a one su nezakonite lokaliteta smanjene, što rezultira smanjenjem regionalnog.
Otkrivanje genoma na selektivnim regijama zamisli obrađuju se izračunavanjem opsežnog indeksa stanovništva (π, FST, tajima d) svih SNP-a unutar kliznog prozora (100 KB) na određenom koraku (10 KB).
Nukleotidna raznolikost (π)
Tajima 'd
Indeks fiksacije (FST)
Wu, et. al.,Molekularna biljka, 2018
3.Geni protok
Wu, et. al.,Molekularna biljka, 2018
4.Demografska historija
Zhang, et. al.,Priroda Ekologija i evolucija, 2021
5. Vrijeme rada
Zhang, et. al.,Priroda Ekologija i evolucija, 2021
Istražite napredak koji su omogućili Evolucijske genetičke usluge BMKGENE kroz kustornu kolekciju publikacija:
Hassanyar, Ak i sur. (2023) 'Otkrivanje molekularnih markera i kandidatkinih moleka povezanih sa rezistencije virusa Sacbrood u APIS Ceran Cerna ličinke po cjelokupnom genomu resequencing',Međunarodni časopis molekularnih nauka, 24 (7). Doi: 10.3390 / IJMS24076238.
Chai, J. et al. (2022) "Otkrivanje divljine, genetski čistog kineskog giganta salamande stvara nove mogućnosti očuvanja",Zoološko istraživanje, 2022, vol. 43, izdanje 3, stranice: 469-480, 43 (3), str. 469-480. Doi: 10.24272 / j.issn.2095-8137.2022.101.
Han, M. i dr. (2022) 'filogeografski obrazac i evolucija stanovništva Istorija autohtonog Elymus Sibiricus L. na Qinghai-tibetan visoravni',Granice u biljnoj nauci, 13, str. 882601. DOI: 10.3389 / FLLS.2022.882601 / Bibtex.
Wang, J. i dr. (2022) 'genominski uvid u lomansku evoluciju iz hromosomenog montaža genomije i stanovništva genomike Longanske pristupe',Istraživanje hortikulture, 9. doi: 10.1093 / hr / uhac021.
