DNBSEQ unaprijed izrađene biblioteke
Karakteristike
●Platforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Načini sekvenciranja:PE150
●Prijenos iluminainske biblioteke naMgi:Omogućavanje sekvenciranja visokih količina podataka po niskim troškovima.
●Kontrola kvalitete biblioteka prije sekvenciranja.
●Podaci o sekvenci QC i isporuka:Isporuka QC izvještaja i neobrađenih podataka u FASTQ formatu nakon promišljanja i filtriranja Q30.
Prednosti
●Svestranost usluga sekvenciranja:Kupac može odabrati redoslijed trakom ili količinom podataka.
●Visoki izlaz podataka:1500 GB / Lane
●Dostava sekvenciranja QC izvještaja:Uz mjerne podatke o kvaliteti, tačnosti podataka i ukupnim performansama projekta sekvenciranja.
●Zreli proces sekvenciranja:sa kratkim vremenom.
●Rigorozna kontrola kvaliteta: Provodimo stroge QC zahtjeve za garantovanje isporuke dosljednih visokokvalitetnih rezultata.
Uzorni zahtjevi
| Iznos podataka (x) | Koncentracija (QPCR / NM) | Zapremina | |
| Djelomična traka
| X ≤ 10 GB | ≥ 1nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 gb | ≥ 4 nm | ||
| Jednostruka traka | Po traci | ≥ 1,5 nm / bibliotečki bazen | ≥ 25 μl / bibliotečki bazen |
Pored koncentracije i ukupnog iznosa, potreban je i odgovarajući vršni obrazac.
Napomena: Trakalne sekvenciranje biblioteka s niskim raznolikošću zahtijeva Phix Spike-in da bi se osiguralo robusno pozivanje baza.
Preporučujemo podnošenje predodvojenih biblioteka kao uzoraka. Ako vam je potreban BMKGENE za obavljanje udruživanja biblioteke, molimo pogledajte
Zahtjevi biblioteke za djelomičnu traku sekvenciranja.
Veličina biblioteke (Peak karta)
Glavni vrh bi trebao biti unutar 300-450 BP.
Biblioteke bi trebale imati jedan glavni vrh, nema kontaminacije adaptera i nijednog temeljnog temelja.
Servisni tijek rada
Bibliotečki qc izvještaj
Izvještaj o kvaliteti biblioteke osiguran je prije sekvenciranja, procjena iznosa biblioteke i fragmentacije.
Sekvencioniranje QC-a izveštaja
Tabela 1. Statistika o sekvenciranju podataka.
| ID uzorka | Bmkid | Sirow Reads | Sirovi podaci (BP) | Čisto glasi (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | Bmk_01 | 22,870,120 | 6.861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | Bmk_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96,00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
Slika 1. Kvalitetna distribucija uz čitanje u svakom uzorku
Slika 2. Distribucija osnovne sadržaje
Slika 3. Distribucija sadržaja čitanja u sekvenciranje podataka
