Illumina unaprijed napravljene biblioteke
Karakteristike
●Platforme:Illumina Novaseq 6000 i Novaseq X Plus
●Načini sekvenciranja:PE150 i PE250
●Kontrola kvaliteta biblioteka prije sekvenciranja
●Podaci o sekvenci QC i isporuka:Isporuka QC izvještaja i sirovih podataka u FASTQ formatu nakon promišljanja i filtriranje Q30 čitanja
Prednosti usluge
●Svestranost usluga sekvenciranja:Kupac može odabrati redoslijed trakom, protočnom ćelijom, ili prema količini potrebnih podataka (djelomična traka za sekvenciranje).
●Opsežno iskustvo na platformi za sekvenciranje Illumina:Sa hiljadama zatvorenih projekata sa raznim vrstama.
●Dostava sekvenciranja QC izvještaja:Uz mjerne podatke o kvaliteti, tačnosti podataka i ukupnim performansama projekta sekvenciranja.
●Zreli proces sekvenciranja:sa kratkim vremenom.
●Rigorozna kontrola kvaliteta: Provodimo stroge QC zahtjeve za garantovanje isporuke dosljednih visokokvalitetnih rezultata.
Prikrivene platforme
| Platforma | Protočna ćelija | Način sekvenciranja | Jedinica | Procijenjeni izlaz |
| Novaseq x | 10b (8 traka) | PE150 | Jednostruka traka Djelomična traka | 375gb / traka |
| 25b (8 traka) | PE150 | Jednostruka traka Djelomična traka | 1000 GB / traka | |
| Novaseq 6000 | SP protočna ćelija (2 trake) | PE250 | Protočna ćelija Jednostruka traka Djelomična traka | 325-400 m glasi / traka |
| S4 ćelija protoka (4 trake) | PE150 | Protočna ćelija Jednostruka traka Djelomična traka | ~ 800 GB / Lane |
Uzorni zahtjevi
| Iznos podataka (x) | Koncentracija (QPCR / NM) | Zapremina | |
| Djelomična traka
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 gb | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Trake sekvenciranje | Po traci | ≥ 1,5 nm / bibliotečki bazen | ≥ 25 μl / bibliotečki bazen |
Pored koncentracije i ukupnog iznosa, potreban je i odgovarajući vršni obrazac.
Napomena: Trakalne sekvenciranje biblioteka s niskim raznolikošću zahtijeva Phix Spike-in da bi se osiguralo robusno pozivanje baza.
Preporučujemo podnošenje predodvojenih biblioteka kao uzoraka. Ako vam je potrebna BMKGENE za obavljanje baze podataka biblioteke, molimo pogledajte
Zahtjevi biblioteke za djelomične trake sekvenciranja.
Veličina biblioteke (Peak karta)
Glavni vrh bi trebao biti unutar 300-450 BP.
Biblioteke bi trebale imati jedan glavni vrh, nema kontaminacije adaptera i nijednog temeljnog temelja.
Molimo vas da nam posegnete ako vaši uzorci ne ispunjavaju početne materijalne zahtjeve.
Servisni tijek rada
Kontrola kvaliteta biblioteke
Sekvenciranje
Kontrola kvaliteta podataka
Dostava projekata
Bibliotečki qc izvještaj
Izvještaj o kvaliteti biblioteke osiguran je prije sekvenciranja, procjena iznosa biblioteke i fragmentacije.
Sekvencioniranje QC-a izveštaja
Tabela 1. Statistika o sekvenciranju podataka.
| ID uzorka | Bmkid | Sirow Reads | Sirovi podaci (BP) | Čisto glasi (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | Bmk_01 | 22,870,120 | 6.861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | Bmk_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96,00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
Slika 1. Kvalitetna distribucija uz čitanje u svakom uzorku
Slika 2. Distribucija osnovne sadržaje
Slika 3. Distribucija sadržaja čitanja u sekvenciranje podataka
