Circrna sekvencing-illumina
Karakteristike
● Iscrpljivanje RRNA uslijedilo je priprema biblioteke usmjerene biblioteke, omogućavajući strand-specifične za sekvenciranje podataka.
● Bioinformatički tijek rada omogućava predviđanje circrna i kvantifikaciju izražavanja
Prednosti usluge
●Sveobuhvatnije RNA biblioteke:Koristimo RRNA Iscrpljivanje umjesto linearnog ispiranja RNA u našoj pripremi pre-biblioteke, osiguravajući da podaci o sekvenciranju ne uključuju ne samo circrna, već i MRNA i LNCRNA, omogućavajući zajedničku analizu ovih podataka ovih podataka
●Opciona analiza konkurentnih endogenih RNA (CERNA) mreža: Pružajući dublje uvide u stanične regulatorne mehanizme
●Opsežna ekspertiza: Uz praćenje za obradu obrade preko 20.000 uzoraka u BMKGENU, obuhvaćajući različite vrste uzoraka i LNCRNA projekata, naš tim donosi bogatstvo iskustva u svakom projektu.
●Rigorozna kontrola kvaliteta: Provodimo osnovne kontrolne tačke na svim fazama, od uzorka i pripreme biblioteke do sekvenciranja i bioinformatike. Ovo pažljivo nadgledanje osigurava isporuku dosljednih visokokvalitetnih rezultata.
● Podrška za post-prodaju: Naša posvećenost se pruža izvan završetka projekta sa tromjesečnim periodom usluge nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekata, rešavanje problema i rješavanje problema i pitanja za rješavanje bilo kakvih upita u vezi s rezultatima.
Uzorak zahtjeva i dostava
| Biblioteka | Platforma | Preporučeni podaci | Podaci QC |
| RRNA biblioteka koja se troši | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Uzorni zahtjevi:
Nukleotidi:
| Conc. (NG / μl) | Iznos (μg) | Čistoća | Integritet |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260 / 280 = 1,7-2,5 OD260 / 230 = 0,5-2,5 Ograničena ili nijedna zaštita ili DNK kontaminacija prikazana na gelu. | Rin≥6.0; 5.0≥28s / 18s≥1.0; ograničena ili nikakva osnovna nadmorsku visinu |
● Biljke:
Root, stabljika ili latica: 450 mg
List ili sjeme: 300 mg
Voće: 1,2 g
● Životinja:
Srce ili crijevo: 450 mg
Viscera ili mozak: 240 mg
Mišić: 600 mg
Kosti, kosa ili koža: 1,5 g
● Arthropods:
Insekti: 9g
Računa: 450 mg
● Cijela krv:2 cevi
● Ćelije: 106 ćelije
● Serum i plazma: 6 ml
Preporučena isporuka uzoraka
Kontejner: 2 ml cijev za centrifuge (limenka folija se ne preporučuje)
Označavanje uzorka: Grupa + replicirana npr. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pošiljka:
1. Suvo led: uzorci moraju biti upakirani u vreće i sahranjeni u suho-ledu.
2. Rnastabible epruvete: uzorci RNA mogu se sušiti u stabilizacijskoj cijevi RNA (npr., Rnaastable®) i isporučuju se na sobnoj temperaturi.
Servisni protok rada
Dizajn eksperimenta
Dostava uzoraka
Ekstrakcija RNA
Građevinarstvo biblioteke
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
BioInformatika
Predviđanje circrne: hromosomska distribucija
Različito izražene circrne - vulkan parcela
Različito izraženo circrnas - hijerarhijski klasteriranje
Funkcionalni obogaćivanje gena host circrna
Istražite istraživačku napretku omogućene BMKGENE 'CIRCRNA sekvenciranje usluga kroz kustornu kolekciju publikacija.
Wang, X. i dr. (2021) 'CPSF4 reguliše formiranje circrne i mikrna posredovanog gena u vitrini u hepatocelularnoj karcinomi ", onkogene 2021 40:25, 40 (25), str. 4338-4351. Doi: 10.1038 / s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'X. X.S-odgovoran transkript otkriva ulogu kružnog RNA133 u otpornosti na bolesti reguliranjem izražavanja Osaraba u rižinom, fitopatološkom istraživanju, 5 (1), str. 1-14. Doi: 10.1186 / s42483-023-00188-8 / brojke / 6.
Y, H. i dr. (2023) 'CPSF3 modulira ravnotežu kružnih i linearnih transkripata u hepatocelularnim karcinomom ". Doi: 10.21203 / Rs.3.rs-2418311 / V1.
Zhang, Y. i dr. (2023) 'Sveobuhvatna evaluacija circrnasa u cirotičnoj kardiomiopatiji prije i nakon transplantacije jetre', međunarodna imunofarmakologija, 114, str. 109495. DOI: 10.1016 / j.intimp.2022.109495.
