CircRNA

Kružne RNK (circRNA) su nekodirajuće RNK koje formiraju kružne strukture i imaju višestruke regulatorne uloge, uključujući nadmetanje s miRNA za ciljne gene i vezivanje proteina. BMKCloud circRNA cjevovod je dizajniran za analizu biblioteka osiromašenih rRNA sa dobro označenim i visokokvalitetnim referentnim genomom. Analiza počinje rezanjem čitanja i kontrolom kvaliteta, nakon čega slijedi usklađivanje čitanja s referentnim genomom i predviđanje novih circRNA, zajedno sa identifikacijom poznatih circRNA iz baza podataka. Odgovarajuće miRNA mete i circRNA domaćini su naknadno identificirani. Analiza diferencijalne ekspresije otkriva različito eksprimirane circRNA, a odgovarajući domaćini su funkcionalno označeni za izdvajanje obogaćenih bioloških funkcija.